Protein–RNA interactions for Protein: Q96DN0

ERP27, Endoplasmic reticulum resident protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERP27Q96DN0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ERP27Q96DN0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ERP27Q96DN0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ERP27Q96DN0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ERP27Q96DN0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ERP27Q96DN0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ERP27Q96DN0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ERP27Q96DN0 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ERP27Q96DN0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.88
ERP27Q96DN0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ERP27Q96DN0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ERP27Q96DN0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ERP27Q96DN0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ERP27Q96DN0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ERP27Q96DN0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ERP27Q96DN0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ERP27Q96DN0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ERP27Q96DN0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERP27Q96DN0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERP27Q96DN0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ERP27Q96DN0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERP27Q96DN0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ERP27Q96DN0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ERP27Q96DN0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ERP27Q96DN0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ERP27Q96DN0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ERP27Q96DN0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ERP27Q96DN0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ERP27Q96DN0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERP27Q96DN0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERP27Q96DN0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ERP27Q96DN0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ERP27Q96DN0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ERP27Q96DN0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ERP27Q96DN0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERP27Q96DN0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERP27Q96DN0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ERP27Q96DN0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ERP27Q96DN0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ERP27Q96DN0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ERP27Q96DN0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ERP27Q96DN0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ERP27Q96DN0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ERP27Q96DN0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ERP27Q96DN0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ERP27Q96DN0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERP27Q96DN0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERP27Q96DN0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ERP27Q96DN0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ERP27Q96DN0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ERP27Q96DN0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ERP27Q96DN0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ERP27Q96DN0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ERP27Q96DN0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ERP27Q96DN0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ERP27Q96DN0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERP27Q96DN0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ERP27Q96DN0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERP27Q96DN0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERP27Q96DN0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ERP27Q96DN0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ERP27Q96DN0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ERP27Q96DN0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
ERP27Q96DN0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERP27Q96DN0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERP27Q96DN0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERP27Q96DN0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERP27Q96DN0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERP27Q96DN0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERP27Q96DN0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERP27Q96DN0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
ERP27Q96DN0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERP27Q96DN0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERP27Q96DN0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ERP27Q96DN0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ERP27Q96DN0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ERP27Q96DN0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ERP27Q96DN0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ERP27Q96DN0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ERP27Q96DN0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ERP27Q96DN0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
ERP27Q96DN0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ERP27Q96DN0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ERP27Q96DN0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ERP27Q96DN0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ERP27Q96DN0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ERP27Q96DN0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ERP27Q96DN0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ERP27Q96DN0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ERP27Q96DN0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ERP27Q96DN0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ERP27Q96DN0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ERP27Q96DN0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
ERP27Q96DN0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ERP27Q96DN0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ERP27Q96DN0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ERP27Q96DN0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ERP27Q96DN0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERP27Q96DN0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ERP27Q96DN0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms