Protein–RNA interactions for Protein: Q96DA2

RAB39B, Ras-related protein Rab-39B, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39BQ96DA2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB39BQ96DA2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB39BQ96DA2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB39BQ96DA2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB39BQ96DA2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB39BQ96DA2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB39BQ96DA2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB39BQ96DA2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB39BQ96DA2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB39BQ96DA2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB39BQ96DA2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB39BQ96DA2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB39BQ96DA2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB39BQ96DA2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB39BQ96DA2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB39BQ96DA2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB39BQ96DA2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB39BQ96DA2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB39BQ96DA2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB39BQ96DA2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB39BQ96DA2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB39BQ96DA2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB39BQ96DA2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB39BQ96DA2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB39BQ96DA2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB39BQ96DA2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB39BQ96DA2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB39BQ96DA2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB39BQ96DA2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB39BQ96DA2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB39BQ96DA2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB39BQ96DA2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB39BQ96DA2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB39BQ96DA2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB39BQ96DA2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RAB39BQ96DA2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB39BQ96DA2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB39BQ96DA2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB39BQ96DA2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB39BQ96DA2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB39BQ96DA2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB39BQ96DA2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB39BQ96DA2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB39BQ96DA2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB39BQ96DA2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB39BQ96DA2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB39BQ96DA2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB39BQ96DA2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB39BQ96DA2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB39BQ96DA2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB39BQ96DA2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB39BQ96DA2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB39BQ96DA2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB39BQ96DA2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB39BQ96DA2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB39BQ96DA2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB39BQ96DA2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB39BQ96DA2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB39BQ96DA2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB39BQ96DA2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB39BQ96DA2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB39BQ96DA2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB39BQ96DA2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB39BQ96DA2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB39BQ96DA2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB39BQ96DA2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB39BQ96DA2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB39BQ96DA2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB39BQ96DA2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB39BQ96DA2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB39BQ96DA2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB39BQ96DA2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB39BQ96DA2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB39BQ96DA2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB39BQ96DA2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB39BQ96DA2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB39BQ96DA2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB39BQ96DA2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB39BQ96DA2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB39BQ96DA2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB39BQ96DA2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB39BQ96DA2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB39BQ96DA2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB39BQ96DA2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB39BQ96DA2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB39BQ96DA2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB39BQ96DA2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB39BQ96DA2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAB39BQ96DA2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB39BQ96DA2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB39BQ96DA2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB39BQ96DA2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB39BQ96DA2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB39BQ96DA2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB39BQ96DA2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB39BQ96DA2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB39BQ96DA2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB39BQ96DA2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB39BQ96DA2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB39BQ96DA2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms