Protein–RNA interactions for Protein: Q96CB8

INTS12, Integrator complex subunit 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS12Q96CB8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
INTS12Q96CB8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
INTS12Q96CB8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
INTS12Q96CB8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
INTS12Q96CB8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
INTS12Q96CB8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
INTS12Q96CB8 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
INTS12Q96CB8 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
INTS12Q96CB8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
INTS12Q96CB8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
INTS12Q96CB8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
INTS12Q96CB8 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
INTS12Q96CB8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
INTS12Q96CB8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
INTS12Q96CB8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
INTS12Q96CB8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
INTS12Q96CB8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
INTS12Q96CB8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
INTS12Q96CB8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
INTS12Q96CB8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
INTS12Q96CB8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
INTS12Q96CB8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
INTS12Q96CB8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
INTS12Q96CB8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
INTS12Q96CB8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
INTS12Q96CB8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
INTS12Q96CB8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
INTS12Q96CB8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
INTS12Q96CB8 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
INTS12Q96CB8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
INTS12Q96CB8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
INTS12Q96CB8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
INTS12Q96CB8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
INTS12Q96CB8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
INTS12Q96CB8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
INTS12Q96CB8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
INTS12Q96CB8 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
INTS12Q96CB8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
INTS12Q96CB8 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
INTS12Q96CB8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
INTS12Q96CB8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
INTS12Q96CB8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
INTS12Q96CB8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
INTS12Q96CB8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
INTS12Q96CB8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
INTS12Q96CB8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
INTS12Q96CB8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
INTS12Q96CB8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
INTS12Q96CB8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
INTS12Q96CB8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
INTS12Q96CB8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
INTS12Q96CB8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
INTS12Q96CB8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
INTS12Q96CB8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
INTS12Q96CB8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
INTS12Q96CB8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
INTS12Q96CB8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
INTS12Q96CB8 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
INTS12Q96CB8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
INTS12Q96CB8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
INTS12Q96CB8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
INTS12Q96CB8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
INTS12Q96CB8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
INTS12Q96CB8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
INTS12Q96CB8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
INTS12Q96CB8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
INTS12Q96CB8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
INTS12Q96CB8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
INTS12Q96CB8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
INTS12Q96CB8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
INTS12Q96CB8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
INTS12Q96CB8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
INTS12Q96CB8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
INTS12Q96CB8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
INTS12Q96CB8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
INTS12Q96CB8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
INTS12Q96CB8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
INTS12Q96CB8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
INTS12Q96CB8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
INTS12Q96CB8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
INTS12Q96CB8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
INTS12Q96CB8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
INTS12Q96CB8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
INTS12Q96CB8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
INTS12Q96CB8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
INTS12Q96CB8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
INTS12Q96CB8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
INTS12Q96CB8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
INTS12Q96CB8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
INTS12Q96CB8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
INTS12Q96CB8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
INTS12Q96CB8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
INTS12Q96CB8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
INTS12Q96CB8 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
INTS12Q96CB8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
INTS12Q96CB8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
INTS12Q96CB8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
INTS12Q96CB8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
INTS12Q96CB8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
INTS12Q96CB8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms