Protein–RNA interactions for Protein: Q96BA8

CREB3L1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L1Q96BA8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CREB3L1Q96BA8 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CREB3L1Q96BA8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CREB3L1Q96BA8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CREB3L1Q96BA8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CREB3L1Q96BA8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CREB3L1Q96BA8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CREB3L1Q96BA8 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CREB3L1Q96BA8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CREB3L1Q96BA8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CREB3L1Q96BA8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CREB3L1Q96BA8 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CREB3L1Q96BA8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CREB3L1Q96BA8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CREB3L1Q96BA8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CREB3L1Q96BA8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CREB3L1Q96BA8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CREB3L1Q96BA8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CREB3L1Q96BA8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CREB3L1Q96BA8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CREB3L1Q96BA8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CREB3L1Q96BA8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CREB3L1Q96BA8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CREB3L1Q96BA8 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CREB3L1Q96BA8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CREB3L1Q96BA8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CREB3L1Q96BA8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CREB3L1Q96BA8 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CREB3L1Q96BA8 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CREB3L1Q96BA8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CREB3L1Q96BA8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CREB3L1Q96BA8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CREB3L1Q96BA8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CREB3L1Q96BA8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CREB3L1Q96BA8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CREB3L1Q96BA8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CREB3L1Q96BA8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CREB3L1Q96BA8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CREB3L1Q96BA8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CREB3L1Q96BA8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CREB3L1Q96BA8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CREB3L1Q96BA8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CREB3L1Q96BA8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CREB3L1Q96BA8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CREB3L1Q96BA8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CREB3L1Q96BA8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CREB3L1Q96BA8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CREB3L1Q96BA8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CREB3L1Q96BA8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CREB3L1Q96BA8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CREB3L1Q96BA8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CREB3L1Q96BA8 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CREB3L1Q96BA8 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CREB3L1Q96BA8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CREB3L1Q96BA8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CREB3L1Q96BA8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CREB3L1Q96BA8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CREB3L1Q96BA8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CREB3L1Q96BA8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CREB3L1Q96BA8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CREB3L1Q96BA8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CREB3L1Q96BA8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CREB3L1Q96BA8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CREB3L1Q96BA8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CREB3L1Q96BA8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CREB3L1Q96BA8 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CREB3L1Q96BA8 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CREB3L1Q96BA8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CREB3L1Q96BA8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CREB3L1Q96BA8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CREB3L1Q96BA8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CREB3L1Q96BA8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CREB3L1Q96BA8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CREB3L1Q96BA8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CREB3L1Q96BA8 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CREB3L1Q96BA8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CREB3L1Q96BA8 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CREB3L1Q96BA8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CREB3L1Q96BA8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CREB3L1Q96BA8 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CREB3L1Q96BA8 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CREB3L1Q96BA8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CREB3L1Q96BA8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CREB3L1Q96BA8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CREB3L1Q96BA8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CREB3L1Q96BA8 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CREB3L1Q96BA8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CREB3L1Q96BA8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CREB3L1Q96BA8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CREB3L1Q96BA8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CREB3L1Q96BA8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CREB3L1Q96BA8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CREB3L1Q96BA8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CREB3L1Q96BA8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CREB3L1Q96BA8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CREB3L1Q96BA8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CREB3L1Q96BA8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CREB3L1Q96BA8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CREB3L1Q96BA8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CREB3L1Q96BA8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms