Protein–RNA interactions for Protein: Q969K7

TMEM54, Transmembrane protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM54Q969K7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM54Q969K7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM54Q969K7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM54Q969K7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM54Q969K7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM54Q969K7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
TMEM54Q969K7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM54Q969K7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM54Q969K7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM54Q969K7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM54Q969K7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM54Q969K7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM54Q969K7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM54Q969K7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM54Q969K7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM54Q969K7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TMEM54Q969K7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM54Q969K7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM54Q969K7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM54Q969K7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM54Q969K7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEM54Q969K7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM54Q969K7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM54Q969K7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM54Q969K7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM54Q969K7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMEM54Q969K7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM54Q969K7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TMEM54Q969K7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TMEM54Q969K7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TMEM54Q969K7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMEM54Q969K7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMEM54Q969K7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMEM54Q969K7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMEM54Q969K7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM54Q969K7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM54Q969K7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM54Q969K7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM54Q969K7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM54Q969K7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMEM54Q969K7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TMEM54Q969K7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMEM54Q969K7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMEM54Q969K7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TMEM54Q969K7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TMEM54Q969K7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TMEM54Q969K7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM54Q969K7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM54Q969K7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM54Q969K7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM54Q969K7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM54Q969K7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM54Q969K7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM54Q969K7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM54Q969K7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM54Q969K7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM54Q969K7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM54Q969K7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM54Q969K7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM54Q969K7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM54Q969K7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM54Q969K7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM54Q969K7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM54Q969K7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM54Q969K7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM54Q969K7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM54Q969K7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM54Q969K7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM54Q969K7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM54Q969K7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM54Q969K7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM54Q969K7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM54Q969K7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM54Q969K7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM54Q969K7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM54Q969K7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM54Q969K7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM54Q969K7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM54Q969K7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM54Q969K7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM54Q969K7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM54Q969K7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM54Q969K7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM54Q969K7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM54Q969K7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM54Q969K7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM54Q969K7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM54Q969K7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM54Q969K7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM54Q969K7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM54Q969K7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM54Q969K7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM54Q969K7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM54Q969K7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM54Q969K7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM54Q969K7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM54Q969K7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMEM54Q969K7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM54Q969K7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM54Q969K7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.4 ms