Protein–RNA interactions for Protein: Q93009

USP7, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP7Q93009 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP7Q93009 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP7Q93009 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP7Q93009 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP7Q93009 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP7Q93009 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP7Q93009 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP7Q93009 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
USP7Q93009 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP7Q93009 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
USP7Q93009 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP7Q93009 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP7Q93009 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP7Q93009 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP7Q93009 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP7Q93009 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP7Q93009 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
USP7Q93009 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP7Q93009 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP7Q93009 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP7Q93009 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP7Q93009 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
USP7Q93009 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP7Q93009 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
USP7Q93009 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP7Q93009 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP7Q93009 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP7Q93009 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
USP7Q93009 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP7Q93009 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP7Q93009 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP7Q93009 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP7Q93009 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP7Q93009 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP7Q93009 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP7Q93009 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP7Q93009 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP7Q93009 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP7Q93009 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP7Q93009 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP7Q93009 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP7Q93009 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP7Q93009 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP7Q93009 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP7Q93009 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP7Q93009 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP7Q93009 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
USP7Q93009 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP7Q93009 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP7Q93009 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP7Q93009 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP7Q93009 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP7Q93009 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP7Q93009 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP7Q93009 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP7Q93009 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP7Q93009 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP7Q93009 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP7Q93009 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP7Q93009 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP7Q93009 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP7Q93009 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP7Q93009 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
USP7Q93009 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP7Q93009 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP7Q93009 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP7Q93009 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP7Q93009 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
USP7Q93009 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP7Q93009 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP7Q93009 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP7Q93009 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP7Q93009 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP7Q93009 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP7Q93009 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP7Q93009 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
USP7Q93009 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
USP7Q93009 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
USP7Q93009 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
USP7Q93009 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
USP7Q93009 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
USP7Q93009 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
USP7Q93009 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
USP7Q93009 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
USP7Q93009 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
USP7Q93009 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
USP7Q93009 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
USP7Q93009 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
USP7Q93009 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
USP7Q93009 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
USP7Q93009 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
USP7Q93009 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
USP7Q93009 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
USP7Q93009 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
USP7Q93009 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
USP7Q93009 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
USP7Q93009 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
USP7Q93009 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
USP7Q93009 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
USP7Q93009 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms