Protein–RNA interactions for Protein: Q92832

NELL1, Protein kinase C-binding protein NELL1, humanhuman

Predictions only

Length 810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELL1Q92832 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NELL1Q92832 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NELL1Q92832 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NELL1Q92832 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NELL1Q92832 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NELL1Q92832 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NELL1Q92832 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NELL1Q92832 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NELL1Q92832 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NELL1Q92832 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NELL1Q92832 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NELL1Q92832 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NELL1Q92832 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NELL1Q92832 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NELL1Q92832 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
NELL1Q92832 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NELL1Q92832 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NELL1Q92832 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NELL1Q92832 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NELL1Q92832 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NELL1Q92832 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NELL1Q92832 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NELL1Q92832 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NELL1Q92832 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NELL1Q92832 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NELL1Q92832 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NELL1Q92832 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NELL1Q92832 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NELL1Q92832 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NELL1Q92832 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NELL1Q92832 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NELL1Q92832 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
NELL1Q92832 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NELL1Q92832 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NELL1Q92832 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NELL1Q92832 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NELL1Q92832 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NELL1Q92832 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NELL1Q92832 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NELL1Q92832 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NELL1Q92832 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NELL1Q92832 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NELL1Q92832 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
NELL1Q92832 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NELL1Q92832 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NELL1Q92832 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NELL1Q92832 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NELL1Q92832 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NELL1Q92832 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
NELL1Q92832 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NELL1Q92832 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NELL1Q92832 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
NELL1Q92832 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NELL1Q92832 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
NELL1Q92832 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NELL1Q92832 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NELL1Q92832 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NELL1Q92832 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NELL1Q92832 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NELL1Q92832 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
NELL1Q92832 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.52■■■□□ 2
NELL1Q92832 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
NELL1Q92832 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NELL1Q92832 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NELL1Q92832 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
NELL1Q92832 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NELL1Q92832 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NELL1Q92832 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NELL1Q92832 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NELL1Q92832 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NELL1Q92832 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NELL1Q92832 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NELL1Q92832 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NELL1Q92832 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
NELL1Q92832 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
NELL1Q92832 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NELL1Q92832 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NELL1Q92832 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NELL1Q92832 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NELL1Q92832 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NELL1Q92832 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NELL1Q92832 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NELL1Q92832 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NELL1Q92832 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NELL1Q92832 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NELL1Q92832 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NELL1Q92832 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NELL1Q92832 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
NELL1Q92832 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NELL1Q92832 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NELL1Q92832 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NELL1Q92832 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NELL1Q92832 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NELL1Q92832 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NELL1Q92832 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NELL1Q92832 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NELL1Q92832 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NELL1Q92832 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NELL1Q92832 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NELL1Q92832 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 604.7 ms