Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TAF4BQ92750 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TAF4BQ92750 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TAF4BQ92750 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
TAF4BQ92750 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TAF4BQ92750 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TAF4BQ92750 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TAF4BQ92750 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
TAF4BQ92750 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TAF4BQ92750 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
TAF4BQ92750 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TAF4BQ92750 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TAF4BQ92750 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TAF4BQ92750 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TAF4BQ92750 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TAF4BQ92750 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TAF4BQ92750 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TAF4BQ92750 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TAF4BQ92750 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TAF4BQ92750 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TAF4BQ92750 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TAF4BQ92750 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TAF4BQ92750 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TAF4BQ92750 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TAF4BQ92750 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TAF4BQ92750 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TAF4BQ92750 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TAF4BQ92750 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TAF4BQ92750 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
TAF4BQ92750 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TAF4BQ92750 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TAF4BQ92750 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
TAF4BQ92750 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TAF4BQ92750 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TAF4BQ92750 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TAF4BQ92750 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TAF4BQ92750 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TAF4BQ92750 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TAF4BQ92750 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TAF4BQ92750 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TAF4BQ92750 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TAF4BQ92750 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TAF4BQ92750 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TAF4BQ92750 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TAF4BQ92750 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TAF4BQ92750 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TAF4BQ92750 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
TAF4BQ92750 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TAF4BQ92750 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TAF4BQ92750 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TAF4BQ92750 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TAF4BQ92750 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TAF4BQ92750 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TAF4BQ92750 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TAF4BQ92750 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TAF4BQ92750 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TAF4BQ92750 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TAF4BQ92750 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TAF4BQ92750 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TAF4BQ92750 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TAF4BQ92750 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TAF4BQ92750 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TAF4BQ92750 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TAF4BQ92750 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
TAF4BQ92750 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
TAF4BQ92750 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
TAF4BQ92750 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TAF4BQ92750 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TAF4BQ92750 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TAF4BQ92750 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TAF4BQ92750 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TAF4BQ92750 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TAF4BQ92750 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TAF4BQ92750 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TAF4BQ92750 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TAF4BQ92750 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TAF4BQ92750 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TAF4BQ92750 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TAF4BQ92750 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TAF4BQ92750 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TAF4BQ92750 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TAF4BQ92750 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TAF4BQ92750 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TAF4BQ92750 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TAF4BQ92750 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TAF4BQ92750 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TAF4BQ92750 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TAF4BQ92750 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TAF4BQ92750 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TAF4BQ92750 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TAF4BQ92750 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TAF4BQ92750 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TAF4BQ92750 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TAF4BQ92750 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
TAF4BQ92750 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TAF4BQ92750 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TAF4BQ92750 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
TAF4BQ92750 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TAF4BQ92750 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TAF4BQ92750 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms