Protein–RNA interactions for Protein: Q92583

CCL17, C-C motif chemokine 17, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL17Q92583 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCL17Q92583 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCL17Q92583 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCL17Q92583 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCL17Q92583 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCL17Q92583 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCL17Q92583 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCL17Q92583 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCL17Q92583 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCL17Q92583 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCL17Q92583 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCL17Q92583 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCL17Q92583 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCL17Q92583 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCL17Q92583 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCL17Q92583 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCL17Q92583 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCL17Q92583 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCL17Q92583 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCL17Q92583 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCL17Q92583 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCL17Q92583 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCL17Q92583 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCL17Q92583 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCL17Q92583 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCL17Q92583 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCL17Q92583 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCL17Q92583 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCL17Q92583 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCL17Q92583 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCL17Q92583 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCL17Q92583 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCL17Q92583 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCL17Q92583 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCL17Q92583 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCL17Q92583 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCL17Q92583 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCL17Q92583 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCL17Q92583 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCL17Q92583 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCL17Q92583 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCL17Q92583 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCL17Q92583 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCL17Q92583 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCL17Q92583 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCL17Q92583 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCL17Q92583 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCL17Q92583 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCL17Q92583 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCL17Q92583 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCL17Q92583 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCL17Q92583 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCL17Q92583 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCL17Q92583 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCL17Q92583 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCL17Q92583 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCL17Q92583 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCL17Q92583 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCL17Q92583 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCL17Q92583 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCL17Q92583 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCL17Q92583 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCL17Q92583 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCL17Q92583 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCL17Q92583 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCL17Q92583 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCL17Q92583 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCL17Q92583 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCL17Q92583 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCL17Q92583 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCL17Q92583 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCL17Q92583 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCL17Q92583 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCL17Q92583 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCL17Q92583 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCL17Q92583 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCL17Q92583 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCL17Q92583 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCL17Q92583 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCL17Q92583 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCL17Q92583 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCL17Q92583 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCL17Q92583 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCL17Q92583 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCL17Q92583 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCL17Q92583 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCL17Q92583 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCL17Q92583 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCL17Q92583 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCL17Q92583 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCL17Q92583 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCL17Q92583 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCL17Q92583 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCL17Q92583 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCL17Q92583 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCL17Q92583 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCL17Q92583 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCL17Q92583 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCL17Q92583 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCL17Q92583 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms