Protein–RNA interactions for Protein: Q92544

TM9SF4, Transmembrane 9 superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM9SF4Q92544 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TM9SF4Q92544 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TM9SF4Q92544 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
TM9SF4Q92544 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TM9SF4Q92544 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TM9SF4Q92544 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TM9SF4Q92544 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TM9SF4Q92544 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TM9SF4Q92544 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TM9SF4Q92544 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TM9SF4Q92544 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TM9SF4Q92544 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TM9SF4Q92544 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TM9SF4Q92544 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TM9SF4Q92544 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TM9SF4Q92544 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TM9SF4Q92544 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TM9SF4Q92544 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TM9SF4Q92544 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TM9SF4Q92544 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TM9SF4Q92544 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TM9SF4Q92544 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TM9SF4Q92544 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TM9SF4Q92544 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TM9SF4Q92544 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TM9SF4Q92544 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TM9SF4Q92544 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TM9SF4Q92544 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TM9SF4Q92544 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TM9SF4Q92544 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TM9SF4Q92544 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TM9SF4Q92544 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TM9SF4Q92544 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TM9SF4Q92544 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TM9SF4Q92544 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TM9SF4Q92544 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TM9SF4Q92544 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TM9SF4Q92544 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TM9SF4Q92544 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TM9SF4Q92544 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TM9SF4Q92544 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TM9SF4Q92544 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TM9SF4Q92544 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TM9SF4Q92544 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TM9SF4Q92544 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TM9SF4Q92544 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TM9SF4Q92544 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TM9SF4Q92544 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TM9SF4Q92544 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TM9SF4Q92544 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TM9SF4Q92544 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TM9SF4Q92544 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TM9SF4Q92544 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TM9SF4Q92544 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TM9SF4Q92544 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TM9SF4Q92544 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TM9SF4Q92544 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TM9SF4Q92544 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TM9SF4Q92544 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TM9SF4Q92544 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TM9SF4Q92544 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TM9SF4Q92544 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TM9SF4Q92544 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TM9SF4Q92544 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TM9SF4Q92544 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TM9SF4Q92544 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TM9SF4Q92544 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TM9SF4Q92544 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TM9SF4Q92544 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TM9SF4Q92544 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TM9SF4Q92544 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TM9SF4Q92544 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TM9SF4Q92544 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TM9SF4Q92544 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TM9SF4Q92544 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TM9SF4Q92544 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TM9SF4Q92544 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TM9SF4Q92544 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TM9SF4Q92544 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TM9SF4Q92544 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TM9SF4Q92544 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TM9SF4Q92544 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TM9SF4Q92544 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TM9SF4Q92544 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TM9SF4Q92544 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TM9SF4Q92544 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TM9SF4Q92544 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TM9SF4Q92544 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TM9SF4Q92544 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TM9SF4Q92544 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TM9SF4Q92544 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TM9SF4Q92544 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TM9SF4Q92544 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TM9SF4Q92544 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TM9SF4Q92544 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TM9SF4Q92544 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TM9SF4Q92544 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TM9SF4Q92544 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TM9SF4Q92544 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TM9SF4Q92544 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms