Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF1

PSPC1, Paraspeckle component 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPC1Q8WXF1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
PSPC1Q8WXF1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
PSPC1Q8WXF1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PSPC1Q8WXF1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PSPC1Q8WXF1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PSPC1Q8WXF1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PSPC1Q8WXF1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
PSPC1Q8WXF1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PSPC1Q8WXF1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PSPC1Q8WXF1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PSPC1Q8WXF1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PSPC1Q8WXF1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
PSPC1Q8WXF1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PSPC1Q8WXF1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PSPC1Q8WXF1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PSPC1Q8WXF1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PSPC1Q8WXF1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
PSPC1Q8WXF1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
PSPC1Q8WXF1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PSPC1Q8WXF1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC30■■■□□ 2.39
PSPC1Q8WXF1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PSPC1Q8WXF1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PSPC1Q8WXF1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
PSPC1Q8WXF1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PSPC1Q8WXF1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
PSPC1Q8WXF1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PSPC1Q8WXF1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PSPC1Q8WXF1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PSPC1Q8WXF1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PSPC1Q8WXF1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PSPC1Q8WXF1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PSPC1Q8WXF1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PSPC1Q8WXF1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PSPC1Q8WXF1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PSPC1Q8WXF1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PSPC1Q8WXF1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PSPC1Q8WXF1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PSPC1Q8WXF1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PSPC1Q8WXF1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
PSPC1Q8WXF1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PSPC1Q8WXF1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PSPC1Q8WXF1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PSPC1Q8WXF1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PSPC1Q8WXF1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
PSPC1Q8WXF1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PSPC1Q8WXF1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PSPC1Q8WXF1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PSPC1Q8WXF1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PSPC1Q8WXF1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PSPC1Q8WXF1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
PSPC1Q8WXF1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PSPC1Q8WXF1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PSPC1Q8WXF1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PSPC1Q8WXF1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PSPC1Q8WXF1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PSPC1Q8WXF1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PSPC1Q8WXF1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PSPC1Q8WXF1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PSPC1Q8WXF1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PSPC1Q8WXF1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PSPC1Q8WXF1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
PSPC1Q8WXF1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
PSPC1Q8WXF1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PSPC1Q8WXF1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PSPC1Q8WXF1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
PSPC1Q8WXF1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PSPC1Q8WXF1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PSPC1Q8WXF1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PSPC1Q8WXF1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PSPC1Q8WXF1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PSPC1Q8WXF1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PSPC1Q8WXF1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PSPC1Q8WXF1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PSPC1Q8WXF1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PSPC1Q8WXF1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PSPC1Q8WXF1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PSPC1Q8WXF1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PSPC1Q8WXF1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PSPC1Q8WXF1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PSPC1Q8WXF1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PSPC1Q8WXF1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PSPC1Q8WXF1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PSPC1Q8WXF1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PSPC1Q8WXF1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PSPC1Q8WXF1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PSPC1Q8WXF1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PSPC1Q8WXF1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PSPC1Q8WXF1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PSPC1Q8WXF1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PSPC1Q8WXF1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PSPC1Q8WXF1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PSPC1Q8WXF1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
PSPC1Q8WXF1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PSPC1Q8WXF1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PSPC1Q8WXF1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PSPC1Q8WXF1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
PSPC1Q8WXF1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PSPC1Q8WXF1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PSPC1Q8WXF1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PSPC1Q8WXF1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
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