Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD9

CASKIN1, Caskin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKIN1Q8WXD9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC43.1■■■■■ 4.49
CASKIN1Q8WXD9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.1■■■■■ 4.49
CASKIN1Q8WXD9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
CASKIN1Q8WXD9 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC43.09■■■■■ 4.49
CASKIN1Q8WXD9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.07■■■■■ 4.49
CASKIN1Q8WXD9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
CASKIN1Q8WXD9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC43.06■■■■■ 4.48
CASKIN1Q8WXD9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
CASKIN1Q8WXD9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
CASKIN1Q8WXD9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.04■■■■■ 4.48
CASKIN1Q8WXD9 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
CASKIN1Q8WXD9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC43■■■■■ 4.47
CASKIN1Q8WXD9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC42.99■■■■■ 4.47
CASKIN1Q8WXD9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
CASKIN1Q8WXD9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
CASKIN1Q8WXD9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC42.98■■■■■ 4.47
CASKIN1Q8WXD9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC42.97■■■■■ 4.47
CASKIN1Q8WXD9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC42.97■■■■■ 4.47
CASKIN1Q8WXD9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
CASKIN1Q8WXD9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
CASKIN1Q8WXD9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.97■■■■■ 4.47
CASKIN1Q8WXD9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
CASKIN1Q8WXD9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
CASKIN1Q8WXD9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.94■■■■■ 4.46
CASKIN1Q8WXD9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
CASKIN1Q8WXD9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
CASKIN1Q8WXD9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
CASKIN1Q8WXD9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
CASKIN1Q8WXD9 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.9■■■■■ 4.46
CASKIN1Q8WXD9 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.45
CASKIN1Q8WXD9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
CASKIN1Q8WXD9 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
CASKIN1Q8WXD9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
CASKIN1Q8WXD9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
CASKIN1Q8WXD9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
CASKIN1Q8WXD9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC42.86■■■■■ 4.45
CASKIN1Q8WXD9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC42.84■■■■■ 4.45
CASKIN1Q8WXD9 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
CASKIN1Q8WXD9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
CASKIN1Q8WXD9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
CASKIN1Q8WXD9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
CASKIN1Q8WXD9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC42.79■■■■■ 4.44
CASKIN1Q8WXD9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
CASKIN1Q8WXD9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC42.77■■■■■ 4.44
CASKIN1Q8WXD9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC42.76■■■■■ 4.44
CASKIN1Q8WXD9 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
CASKIN1Q8WXD9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
CASKIN1Q8WXD9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
CASKIN1Q8WXD9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC42.74■■■■■ 4.43
CASKIN1Q8WXD9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
CASKIN1Q8WXD9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.71■■■■■ 4.43
CASKIN1Q8WXD9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.71■■■■■ 4.43
CASKIN1Q8WXD9 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
CASKIN1Q8WXD9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
CASKIN1Q8WXD9 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
CASKIN1Q8WXD9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
CASKIN1Q8WXD9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC42.7■■■■■ 4.43
CASKIN1Q8WXD9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
CASKIN1Q8WXD9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
CASKIN1Q8WXD9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC42.68■■■■■ 4.42
CASKIN1Q8WXD9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC42.68■■■■■ 4.42
CASKIN1Q8WXD9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC42.68■■■■■ 4.42
CASKIN1Q8WXD9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC42.67■■■■■ 4.42
CASKIN1Q8WXD9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
CASKIN1Q8WXD9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC42.67■■■■■ 4.42
CASKIN1Q8WXD9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
CASKIN1Q8WXD9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
CASKIN1Q8WXD9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
CASKIN1Q8WXD9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
CASKIN1Q8WXD9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC42.66■■■■■ 4.42
CASKIN1Q8WXD9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC42.65■■■■■ 4.42
CASKIN1Q8WXD9 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
CASKIN1Q8WXD9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC42.64■■■■■ 4.42
CASKIN1Q8WXD9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.42
CASKIN1Q8WXD9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.42
CASKIN1Q8WXD9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.41
CASKIN1Q8WXD9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC42.63■■■■■ 4.41
CASKIN1Q8WXD9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC42.63■■■■■ 4.41
CASKIN1Q8WXD9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
CASKIN1Q8WXD9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
CASKIN1Q8WXD9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC42.56■■■■■ 4.4
CASKIN1Q8WXD9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC42.56■■■■■ 4.4
CASKIN1Q8WXD9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.56■■■■■ 4.4
CASKIN1Q8WXD9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC42.54■■■■■ 4.4
CASKIN1Q8WXD9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
CASKIN1Q8WXD9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
CASKIN1Q8WXD9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC42.51■■■■■ 4.4
CASKIN1Q8WXD9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
CASKIN1Q8WXD9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC42.5■■■■■ 4.39
CASKIN1Q8WXD9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
CASKIN1Q8WXD9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC42.49■■■■■ 4.39
CASKIN1Q8WXD9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
CASKIN1Q8WXD9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
CASKIN1Q8WXD9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
CASKIN1Q8WXD9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
CASKIN1Q8WXD9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
CASKIN1Q8WXD9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
CASKIN1Q8WXD9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC42.45■■■■■ 4.39
CASKIN1Q8WXD9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC42.45■■■■■ 4.39
CASKIN1Q8WXD9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms