Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWW8

GAB3, GRB2-associated-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAB3Q8WWW8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GAB3Q8WWW8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GAB3Q8WWW8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GAB3Q8WWW8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GAB3Q8WWW8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GAB3Q8WWW8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GAB3Q8WWW8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GAB3Q8WWW8 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
GAB3Q8WWW8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
GAB3Q8WWW8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GAB3Q8WWW8 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GAB3Q8WWW8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GAB3Q8WWW8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GAB3Q8WWW8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GAB3Q8WWW8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GAB3Q8WWW8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GAB3Q8WWW8 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GAB3Q8WWW8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GAB3Q8WWW8 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GAB3Q8WWW8 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GAB3Q8WWW8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GAB3Q8WWW8 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
GAB3Q8WWW8 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GAB3Q8WWW8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GAB3Q8WWW8 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GAB3Q8WWW8 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GAB3Q8WWW8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GAB3Q8WWW8 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GAB3Q8WWW8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GAB3Q8WWW8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
GAB3Q8WWW8 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GAB3Q8WWW8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GAB3Q8WWW8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GAB3Q8WWW8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
GAB3Q8WWW8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
GAB3Q8WWW8 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GAB3Q8WWW8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
GAB3Q8WWW8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GAB3Q8WWW8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GAB3Q8WWW8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
GAB3Q8WWW8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
GAB3Q8WWW8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GAB3Q8WWW8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GAB3Q8WWW8 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GAB3Q8WWW8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GAB3Q8WWW8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GAB3Q8WWW8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GAB3Q8WWW8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GAB3Q8WWW8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GAB3Q8WWW8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
GAB3Q8WWW8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GAB3Q8WWW8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GAB3Q8WWW8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GAB3Q8WWW8 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
GAB3Q8WWW8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GAB3Q8WWW8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GAB3Q8WWW8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GAB3Q8WWW8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GAB3Q8WWW8 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GAB3Q8WWW8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GAB3Q8WWW8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GAB3Q8WWW8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
GAB3Q8WWW8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GAB3Q8WWW8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GAB3Q8WWW8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GAB3Q8WWW8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GAB3Q8WWW8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GAB3Q8WWW8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GAB3Q8WWW8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GAB3Q8WWW8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GAB3Q8WWW8 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
GAB3Q8WWW8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
GAB3Q8WWW8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GAB3Q8WWW8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GAB3Q8WWW8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GAB3Q8WWW8 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GAB3Q8WWW8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GAB3Q8WWW8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GAB3Q8WWW8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GAB3Q8WWW8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GAB3Q8WWW8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
GAB3Q8WWW8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GAB3Q8WWW8 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GAB3Q8WWW8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GAB3Q8WWW8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GAB3Q8WWW8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GAB3Q8WWW8 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GAB3Q8WWW8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
GAB3Q8WWW8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GAB3Q8WWW8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GAB3Q8WWW8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GAB3Q8WWW8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GAB3Q8WWW8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GAB3Q8WWW8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GAB3Q8WWW8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GAB3Q8WWW8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GAB3Q8WWW8 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GAB3Q8WWW8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GAB3Q8WWW8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GAB3Q8WWW8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms