Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCF0

CLEC18C, C-type lectin domain family 18 member C, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC18CQ8NCF0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLEC18CQ8NCF0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLEC18CQ8NCF0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLEC18CQ8NCF0 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLEC18CQ8NCF0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLEC18CQ8NCF0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLEC18CQ8NCF0 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLEC18CQ8NCF0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLEC18CQ8NCF0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLEC18CQ8NCF0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLEC18CQ8NCF0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLEC18CQ8NCF0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLEC18CQ8NCF0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLEC18CQ8NCF0 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLEC18CQ8NCF0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLEC18CQ8NCF0 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLEC18CQ8NCF0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLEC18CQ8NCF0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLEC18CQ8NCF0 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLEC18CQ8NCF0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLEC18CQ8NCF0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLEC18CQ8NCF0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLEC18CQ8NCF0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLEC18CQ8NCF0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CLEC18CQ8NCF0 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CLEC18CQ8NCF0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLEC18CQ8NCF0 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLEC18CQ8NCF0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLEC18CQ8NCF0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLEC18CQ8NCF0 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLEC18CQ8NCF0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLEC18CQ8NCF0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLEC18CQ8NCF0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CLEC18CQ8NCF0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CLEC18CQ8NCF0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLEC18CQ8NCF0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLEC18CQ8NCF0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLEC18CQ8NCF0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CLEC18CQ8NCF0 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLEC18CQ8NCF0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLEC18CQ8NCF0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLEC18CQ8NCF0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLEC18CQ8NCF0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLEC18CQ8NCF0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLEC18CQ8NCF0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLEC18CQ8NCF0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CLEC18CQ8NCF0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLEC18CQ8NCF0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLEC18CQ8NCF0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CLEC18CQ8NCF0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLEC18CQ8NCF0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLEC18CQ8NCF0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLEC18CQ8NCF0 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLEC18CQ8NCF0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLEC18CQ8NCF0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLEC18CQ8NCF0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLEC18CQ8NCF0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLEC18CQ8NCF0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLEC18CQ8NCF0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLEC18CQ8NCF0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLEC18CQ8NCF0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLEC18CQ8NCF0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CLEC18CQ8NCF0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLEC18CQ8NCF0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLEC18CQ8NCF0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLEC18CQ8NCF0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLEC18CQ8NCF0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLEC18CQ8NCF0 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLEC18CQ8NCF0 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLEC18CQ8NCF0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLEC18CQ8NCF0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLEC18CQ8NCF0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLEC18CQ8NCF0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLEC18CQ8NCF0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLEC18CQ8NCF0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLEC18CQ8NCF0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLEC18CQ8NCF0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CLEC18CQ8NCF0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CLEC18CQ8NCF0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CLEC18CQ8NCF0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLEC18CQ8NCF0 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLEC18CQ8NCF0 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLEC18CQ8NCF0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLEC18CQ8NCF0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLEC18CQ8NCF0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLEC18CQ8NCF0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLEC18CQ8NCF0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLEC18CQ8NCF0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLEC18CQ8NCF0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CLEC18CQ8NCF0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLEC18CQ8NCF0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLEC18CQ8NCF0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLEC18CQ8NCF0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLEC18CQ8NCF0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLEC18CQ8NCF0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CLEC18CQ8NCF0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLEC18CQ8NCF0 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLEC18CQ8NCF0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLEC18CQ8NCF0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLEC18CQ8NCF0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms