Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4C0

C9orf62, Putative uncharacterized protein C9orf62, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf62Q8N4C0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C9orf62Q8N4C0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C9orf62Q8N4C0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C9orf62Q8N4C0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C9orf62Q8N4C0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C9orf62Q8N4C0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C9orf62Q8N4C0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C9orf62Q8N4C0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C9orf62Q8N4C0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C9orf62Q8N4C0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C9orf62Q8N4C0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C9orf62Q8N4C0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C9orf62Q8N4C0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C9orf62Q8N4C0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C9orf62Q8N4C0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C9orf62Q8N4C0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C9orf62Q8N4C0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C9orf62Q8N4C0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
C9orf62Q8N4C0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C9orf62Q8N4C0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C9orf62Q8N4C0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C9orf62Q8N4C0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C9orf62Q8N4C0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C9orf62Q8N4C0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C9orf62Q8N4C0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C9orf62Q8N4C0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C9orf62Q8N4C0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9orf62Q8N4C0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9orf62Q8N4C0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9orf62Q8N4C0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9orf62Q8N4C0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9orf62Q8N4C0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
C9orf62Q8N4C0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C9orf62Q8N4C0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C9orf62Q8N4C0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C9orf62Q8N4C0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C9orf62Q8N4C0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C9orf62Q8N4C0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C9orf62Q8N4C0 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C9orf62Q8N4C0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C9orf62Q8N4C0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C9orf62Q8N4C0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C9orf62Q8N4C0 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C9orf62Q8N4C0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C9orf62Q8N4C0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C9orf62Q8N4C0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C9orf62Q8N4C0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C9orf62Q8N4C0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C9orf62Q8N4C0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C9orf62Q8N4C0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C9orf62Q8N4C0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C9orf62Q8N4C0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
C9orf62Q8N4C0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C9orf62Q8N4C0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C9orf62Q8N4C0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C9orf62Q8N4C0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C9orf62Q8N4C0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C9orf62Q8N4C0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C9orf62Q8N4C0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C9orf62Q8N4C0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C9orf62Q8N4C0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C9orf62Q8N4C0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C9orf62Q8N4C0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C9orf62Q8N4C0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C9orf62Q8N4C0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C9orf62Q8N4C0 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C9orf62Q8N4C0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
C9orf62Q8N4C0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C9orf62Q8N4C0 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
C9orf62Q8N4C0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
C9orf62Q8N4C0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C9orf62Q8N4C0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C9orf62Q8N4C0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C9orf62Q8N4C0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C9orf62Q8N4C0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C9orf62Q8N4C0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C9orf62Q8N4C0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C9orf62Q8N4C0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C9orf62Q8N4C0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C9orf62Q8N4C0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C9orf62Q8N4C0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C9orf62Q8N4C0 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C9orf62Q8N4C0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C9orf62Q8N4C0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C9orf62Q8N4C0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C9orf62Q8N4C0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C9orf62Q8N4C0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C9orf62Q8N4C0 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C9orf62Q8N4C0 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C9orf62Q8N4C0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C9orf62Q8N4C0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C9orf62Q8N4C0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C9orf62Q8N4C0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C9orf62Q8N4C0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C9orf62Q8N4C0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C9orf62Q8N4C0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C9orf62Q8N4C0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C9orf62Q8N4C0 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C9orf62Q8N4C0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C9orf62Q8N4C0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 198 ms