Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3P4

VPS8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS8Q8N3P4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
VPS8Q8N3P4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC43.11■■■■■ 4.49
VPS8Q8N3P4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.11■■■■■ 4.49
VPS8Q8N3P4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
VPS8Q8N3P4 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.49
VPS8Q8N3P4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
VPS8Q8N3P4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
VPS8Q8N3P4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
VPS8Q8N3P4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC43.02■■■■■ 4.48
VPS8Q8N3P4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
VPS8Q8N3P4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC43.02■■■■■ 4.48
VPS8Q8N3P4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
VPS8Q8N3P4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC43■■■■■ 4.47
VPS8Q8N3P4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43■■■■■ 4.47
VPS8Q8N3P4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC42.98■■■■■ 4.47
VPS8Q8N3P4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC42.96■■■■■ 4.47
VPS8Q8N3P4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
VPS8Q8N3P4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC42.91■■■■■ 4.46
VPS8Q8N3P4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
VPS8Q8N3P4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
VPS8Q8N3P4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC42.89■■■■■ 4.46
VPS8Q8N3P4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC42.89■■■■■ 4.46
VPS8Q8N3P4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.46
VPS8Q8N3P4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.45
VPS8Q8N3P4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
VPS8Q8N3P4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.86■■■■■ 4.45
VPS8Q8N3P4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
VPS8Q8N3P4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
VPS8Q8N3P4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.81■■■■■ 4.44
VPS8Q8N3P4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
VPS8Q8N3P4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
VPS8Q8N3P4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC42.8■■■■■ 4.44
VPS8Q8N3P4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC42.8■■■■■ 4.44
VPS8Q8N3P4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
VPS8Q8N3P4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC42.78■■■■■ 4.44
VPS8Q8N3P4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC42.78■■■■■ 4.44
VPS8Q8N3P4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
VPS8Q8N3P4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
VPS8Q8N3P4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC42.71■■■■■ 4.43
VPS8Q8N3P4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
VPS8Q8N3P4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC42.71■■■■■ 4.43
VPS8Q8N3P4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
VPS8Q8N3P4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC42.7■■■■■ 4.43
VPS8Q8N3P4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
VPS8Q8N3P4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC42.69■■■■■ 4.42
VPS8Q8N3P4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
VPS8Q8N3P4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC42.68■■■■■ 4.42
VPS8Q8N3P4 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
VPS8Q8N3P4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC42.67■■■■■ 4.42
VPS8Q8N3P4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
VPS8Q8N3P4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC42.65■■■■■ 4.42
VPS8Q8N3P4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC42.65■■■■■ 4.42
VPS8Q8N3P4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
VPS8Q8N3P4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.64■■■■■ 4.42
VPS8Q8N3P4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
VPS8Q8N3P4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
VPS8Q8N3P4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
VPS8Q8N3P4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
VPS8Q8N3P4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.6■■■■■ 4.41
VPS8Q8N3P4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
VPS8Q8N3P4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
VPS8Q8N3P4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
VPS8Q8N3P4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
VPS8Q8N3P4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
VPS8Q8N3P4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.41
VPS8Q8N3P4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.56■■■■■ 4.4
VPS8Q8N3P4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC42.56■■■■■ 4.4
VPS8Q8N3P4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
VPS8Q8N3P4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
VPS8Q8N3P4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.54■■■■■ 4.4
VPS8Q8N3P4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC42.54■■■■■ 4.4
VPS8Q8N3P4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC42.53■■■■■ 4.4
VPS8Q8N3P4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC42.5■■■■■ 4.39
VPS8Q8N3P4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
VPS8Q8N3P4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
VPS8Q8N3P4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC42.46■■■■■ 4.39
VPS8Q8N3P4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
VPS8Q8N3P4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
VPS8Q8N3P4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
VPS8Q8N3P4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
VPS8Q8N3P4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
VPS8Q8N3P4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
VPS8Q8N3P4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC42.43■■■■■ 4.38
VPS8Q8N3P4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC42.42■■■■■ 4.38
VPS8Q8N3P4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.42■■■■■ 4.38
VPS8Q8N3P4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
VPS8Q8N3P4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
VPS8Q8N3P4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
VPS8Q8N3P4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC42.38■■■■■ 4.38
VPS8Q8N3P4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
VPS8Q8N3P4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
VPS8Q8N3P4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC42.34■■■■■ 4.37
VPS8Q8N3P4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC42.34■■■■■ 4.37
VPS8Q8N3P4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.34■■■■■ 4.37
VPS8Q8N3P4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
VPS8Q8N3P4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC42.33■■■■■ 4.37
VPS8Q8N3P4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC42.32■■■■■ 4.37
VPS8Q8N3P4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC42.31■■■■■ 4.36
VPS8Q8N3P4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
VPS8Q8N3P4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms