Protein–RNA interactions for Protein: Q8N135

LGI4, Leucine-rich repeat LGI family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGI4Q8N135 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LGI4Q8N135 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LGI4Q8N135 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LGI4Q8N135 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LGI4Q8N135 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LGI4Q8N135 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LGI4Q8N135 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
LGI4Q8N135 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LGI4Q8N135 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LGI4Q8N135 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LGI4Q8N135 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LGI4Q8N135 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LGI4Q8N135 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LGI4Q8N135 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LGI4Q8N135 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LGI4Q8N135 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LGI4Q8N135 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LGI4Q8N135 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LGI4Q8N135 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LGI4Q8N135 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LGI4Q8N135 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LGI4Q8N135 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LGI4Q8N135 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LGI4Q8N135 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LGI4Q8N135 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LGI4Q8N135 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
LGI4Q8N135 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LGI4Q8N135 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LGI4Q8N135 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LGI4Q8N135 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LGI4Q8N135 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LGI4Q8N135 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LGI4Q8N135 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
LGI4Q8N135 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LGI4Q8N135 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LGI4Q8N135 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LGI4Q8N135 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LGI4Q8N135 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LGI4Q8N135 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LGI4Q8N135 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LGI4Q8N135 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LGI4Q8N135 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LGI4Q8N135 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LGI4Q8N135 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LGI4Q8N135 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
LGI4Q8N135 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LGI4Q8N135 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LGI4Q8N135 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
LGI4Q8N135 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LGI4Q8N135 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LGI4Q8N135 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LGI4Q8N135 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LGI4Q8N135 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LGI4Q8N135 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LGI4Q8N135 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LGI4Q8N135 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LGI4Q8N135 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LGI4Q8N135 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LGI4Q8N135 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LGI4Q8N135 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LGI4Q8N135 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LGI4Q8N135 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LGI4Q8N135 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LGI4Q8N135 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LGI4Q8N135 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LGI4Q8N135 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LGI4Q8N135 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LGI4Q8N135 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LGI4Q8N135 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LGI4Q8N135 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LGI4Q8N135 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LGI4Q8N135 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LGI4Q8N135 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LGI4Q8N135 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LGI4Q8N135 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LGI4Q8N135 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LGI4Q8N135 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LGI4Q8N135 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LGI4Q8N135 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LGI4Q8N135 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LGI4Q8N135 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
LGI4Q8N135 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LGI4Q8N135 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LGI4Q8N135 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LGI4Q8N135 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
LGI4Q8N135 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LGI4Q8N135 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LGI4Q8N135 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
LGI4Q8N135 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LGI4Q8N135 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LGI4Q8N135 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LGI4Q8N135 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LGI4Q8N135 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LGI4Q8N135 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LGI4Q8N135 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LGI4Q8N135 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LGI4Q8N135 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LGI4Q8N135 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
LGI4Q8N135 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LGI4Q8N135 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 175 ms