Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC117Q8IWD4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC117Q8IWD4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC117Q8IWD4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC117Q8IWD4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC117Q8IWD4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC117Q8IWD4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC117Q8IWD4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC117Q8IWD4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC117Q8IWD4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC117Q8IWD4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC117Q8IWD4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC117Q8IWD4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC117Q8IWD4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC117Q8IWD4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC117Q8IWD4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC117Q8IWD4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC117Q8IWD4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC117Q8IWD4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC117Q8IWD4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC117Q8IWD4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC117Q8IWD4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC117Q8IWD4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC117Q8IWD4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC117Q8IWD4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC117Q8IWD4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC117Q8IWD4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC117Q8IWD4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC117Q8IWD4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC117Q8IWD4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC117Q8IWD4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC117Q8IWD4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC117Q8IWD4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC117Q8IWD4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC117Q8IWD4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC117Q8IWD4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC117Q8IWD4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC117Q8IWD4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC117Q8IWD4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC117Q8IWD4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC117Q8IWD4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC117Q8IWD4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC117Q8IWD4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC117Q8IWD4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC117Q8IWD4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC117Q8IWD4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC117Q8IWD4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC117Q8IWD4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC117Q8IWD4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC117Q8IWD4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC117Q8IWD4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC117Q8IWD4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC117Q8IWD4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC117Q8IWD4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC117Q8IWD4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC117Q8IWD4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC117Q8IWD4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC117Q8IWD4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC117Q8IWD4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC117Q8IWD4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC117Q8IWD4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC117Q8IWD4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC117Q8IWD4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC117Q8IWD4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC117Q8IWD4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC117Q8IWD4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC117Q8IWD4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC117Q8IWD4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC117Q8IWD4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC117Q8IWD4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC117Q8IWD4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC117Q8IWD4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC117Q8IWD4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC117Q8IWD4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC117Q8IWD4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC117Q8IWD4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC117Q8IWD4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC117Q8IWD4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC117Q8IWD4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC117Q8IWD4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC117Q8IWD4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC117Q8IWD4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC117Q8IWD4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC117Q8IWD4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC117Q8IWD4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC117Q8IWD4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC117Q8IWD4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC117Q8IWD4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC117Q8IWD4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC117Q8IWD4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC117Q8IWD4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC117Q8IWD4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC117Q8IWD4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC117Q8IWD4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC117Q8IWD4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC117Q8IWD4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC117Q8IWD4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC117Q8IWD4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC117Q8IWD4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC117Q8IWD4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms