Protein–RNA interactions for Protein: Q86YN6

PPARGC1B, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1BQ86YN6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
PPARGC1BQ86YN6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
PPARGC1BQ86YN6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
PPARGC1BQ86YN6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
PPARGC1BQ86YN6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC42.72■■■■■ 4.43
PPARGC1BQ86YN6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC42.71■■■■■ 4.43
PPARGC1BQ86YN6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.7■■■■■ 4.43
PPARGC1BQ86YN6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
PPARGC1BQ86YN6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
PPARGC1BQ86YN6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
PPARGC1BQ86YN6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.42
PPARGC1BQ86YN6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.42
PPARGC1BQ86YN6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC42.63■■■■■ 4.41
PPARGC1BQ86YN6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
PPARGC1BQ86YN6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
PPARGC1BQ86YN6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
PPARGC1BQ86YN6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
PPARGC1BQ86YN6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC42.61■■■■■ 4.41
PPARGC1BQ86YN6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
PPARGC1BQ86YN6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC42.58■■■■■ 4.41
PPARGC1BQ86YN6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.41
PPARGC1BQ86YN6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.57■■■■■ 4.41
PPARGC1BQ86YN6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC42.57■■■■■ 4.41
PPARGC1BQ86YN6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
PPARGC1BQ86YN6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC42.55■■■■■ 4.4
PPARGC1BQ86YN6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
PPARGC1BQ86YN6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
PPARGC1BQ86YN6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC42.54■■■■■ 4.4
PPARGC1BQ86YN6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC42.53■■■■■ 4.4
PPARGC1BQ86YN6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC42.52■■■■■ 4.4
PPARGC1BQ86YN6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC42.52■■■■■ 4.4
PPARGC1BQ86YN6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
PPARGC1BQ86YN6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC42.51■■■■■ 4.4
PPARGC1BQ86YN6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.39
PPARGC1BQ86YN6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.5■■■■■ 4.39
PPARGC1BQ86YN6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.5■■■■■ 4.39
PPARGC1BQ86YN6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC42.49■■■■■ 4.39
PPARGC1BQ86YN6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
PPARGC1BQ86YN6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC42.48■■■■■ 4.39
PPARGC1BQ86YN6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
PPARGC1BQ86YN6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC42.45■■■■■ 4.39
PPARGC1BQ86YN6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
PPARGC1BQ86YN6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
PPARGC1BQ86YN6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
PPARGC1BQ86YN6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
PPARGC1BQ86YN6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.38
PPARGC1BQ86YN6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC42.37■■■■■ 4.37
PPARGC1BQ86YN6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC42.36■■■■■ 4.37
PPARGC1BQ86YN6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
PPARGC1BQ86YN6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
PPARGC1BQ86YN6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC42.33■■■■■ 4.37
PPARGC1BQ86YN6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.37
PPARGC1BQ86YN6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
PPARGC1BQ86YN6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
PPARGC1BQ86YN6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
PPARGC1BQ86YN6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
PPARGC1BQ86YN6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
PPARGC1BQ86YN6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
PPARGC1BQ86YN6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC42.26■■■■■ 4.36
PPARGC1BQ86YN6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42.25■■■■■ 4.35
PPARGC1BQ86YN6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.24■■■■■ 4.35
PPARGC1BQ86YN6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC42.21■■■■■ 4.35
PPARGC1BQ86YN6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
PPARGC1BQ86YN6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC42.19■■■■■ 4.34
PPARGC1BQ86YN6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC42.18■■■■■ 4.34
PPARGC1BQ86YN6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
PPARGC1BQ86YN6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC42.15■■■■■ 4.34
PPARGC1BQ86YN6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.13■■■■■ 4.34
PPARGC1BQ86YN6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
PPARGC1BQ86YN6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
PPARGC1BQ86YN6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
PPARGC1BQ86YN6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
PPARGC1BQ86YN6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC42.11■■■■■ 4.33
PPARGC1BQ86YN6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC42.1■■■■■ 4.33
PPARGC1BQ86YN6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC42.06■■■■■ 4.32
PPARGC1BQ86YN6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
PPARGC1BQ86YN6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
PPARGC1BQ86YN6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
PPARGC1BQ86YN6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC42.04■■■■■ 4.32
PPARGC1BQ86YN6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
PPARGC1BQ86YN6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
PPARGC1BQ86YN6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
PPARGC1BQ86YN6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.02■■■■■ 4.32
PPARGC1BQ86YN6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
PPARGC1BQ86YN6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
PPARGC1BQ86YN6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
PPARGC1BQ86YN6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
PPARGC1BQ86YN6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
PPARGC1BQ86YN6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
PPARGC1BQ86YN6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
PPARGC1BQ86YN6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC41.97■■■■■ 4.31
PPARGC1BQ86YN6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
PPARGC1BQ86YN6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
PPARGC1BQ86YN6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
PPARGC1BQ86YN6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
PPARGC1BQ86YN6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC41.94■■■■■ 4.3
PPARGC1BQ86YN6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC41.93■■■■■ 4.3
PPARGC1BQ86YN6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
PPARGC1BQ86YN6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC41.92■■■■■ 4.3
PPARGC1BQ86YN6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms