Protein–RNA interactions for Protein: Q86VF2

IGFN1, Immunoglobulin-like and fibronectin type III domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGFN1Q86VF2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IGFN1Q86VF2 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IGFN1Q86VF2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IGFN1Q86VF2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IGFN1Q86VF2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
IGFN1Q86VF2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
IGFN1Q86VF2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
IGFN1Q86VF2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IGFN1Q86VF2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IGFN1Q86VF2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IGFN1Q86VF2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IGFN1Q86VF2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IGFN1Q86VF2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IGFN1Q86VF2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IGFN1Q86VF2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IGFN1Q86VF2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IGFN1Q86VF2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IGFN1Q86VF2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
IGFN1Q86VF2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IGFN1Q86VF2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IGFN1Q86VF2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IGFN1Q86VF2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IGFN1Q86VF2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IGFN1Q86VF2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IGFN1Q86VF2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IGFN1Q86VF2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IGFN1Q86VF2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IGFN1Q86VF2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IGFN1Q86VF2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
IGFN1Q86VF2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IGFN1Q86VF2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IGFN1Q86VF2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IGFN1Q86VF2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
IGFN1Q86VF2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IGFN1Q86VF2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IGFN1Q86VF2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IGFN1Q86VF2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IGFN1Q86VF2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IGFN1Q86VF2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IGFN1Q86VF2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IGFN1Q86VF2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IGFN1Q86VF2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IGFN1Q86VF2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IGFN1Q86VF2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IGFN1Q86VF2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IGFN1Q86VF2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IGFN1Q86VF2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IGFN1Q86VF2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IGFN1Q86VF2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IGFN1Q86VF2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IGFN1Q86VF2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IGFN1Q86VF2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IGFN1Q86VF2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IGFN1Q86VF2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IGFN1Q86VF2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IGFN1Q86VF2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IGFN1Q86VF2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IGFN1Q86VF2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IGFN1Q86VF2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IGFN1Q86VF2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IGFN1Q86VF2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IGFN1Q86VF2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IGFN1Q86VF2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IGFN1Q86VF2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IGFN1Q86VF2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
IGFN1Q86VF2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
IGFN1Q86VF2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
IGFN1Q86VF2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IGFN1Q86VF2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IGFN1Q86VF2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IGFN1Q86VF2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IGFN1Q86VF2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IGFN1Q86VF2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IGFN1Q86VF2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IGFN1Q86VF2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IGFN1Q86VF2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IGFN1Q86VF2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IGFN1Q86VF2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IGFN1Q86VF2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IGFN1Q86VF2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IGFN1Q86VF2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IGFN1Q86VF2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IGFN1Q86VF2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IGFN1Q86VF2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IGFN1Q86VF2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IGFN1Q86VF2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IGFN1Q86VF2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IGFN1Q86VF2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IGFN1Q86VF2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IGFN1Q86VF2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IGFN1Q86VF2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IGFN1Q86VF2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IGFN1Q86VF2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IGFN1Q86VF2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IGFN1Q86VF2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IGFN1Q86VF2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IGFN1Q86VF2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IGFN1Q86VF2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IGFN1Q86VF2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IGFN1Q86VF2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms