Protein–RNA interactions for Protein: Q86UV7

TRIM73, Tripartite motif-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM73Q86UV7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM73Q86UV7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM73Q86UV7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM73Q86UV7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM73Q86UV7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM73Q86UV7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM73Q86UV7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM73Q86UV7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM73Q86UV7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM73Q86UV7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM73Q86UV7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM73Q86UV7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
TRIM73Q86UV7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM73Q86UV7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM73Q86UV7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM73Q86UV7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM73Q86UV7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM73Q86UV7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM73Q86UV7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM73Q86UV7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRIM73Q86UV7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIM73Q86UV7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIM73Q86UV7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRIM73Q86UV7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRIM73Q86UV7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM73Q86UV7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM73Q86UV7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM73Q86UV7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM73Q86UV7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM73Q86UV7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM73Q86UV7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM73Q86UV7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM73Q86UV7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM73Q86UV7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM73Q86UV7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM73Q86UV7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM73Q86UV7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM73Q86UV7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM73Q86UV7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM73Q86UV7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM73Q86UV7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM73Q86UV7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM73Q86UV7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM73Q86UV7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM73Q86UV7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM73Q86UV7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM73Q86UV7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM73Q86UV7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TRIM73Q86UV7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM73Q86UV7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM73Q86UV7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM73Q86UV7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM73Q86UV7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM73Q86UV7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM73Q86UV7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM73Q86UV7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM73Q86UV7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM73Q86UV7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM73Q86UV7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM73Q86UV7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM73Q86UV7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM73Q86UV7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRIM73Q86UV7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM73Q86UV7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM73Q86UV7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM73Q86UV7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM73Q86UV7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM73Q86UV7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM73Q86UV7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM73Q86UV7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM73Q86UV7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRIM73Q86UV7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM73Q86UV7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM73Q86UV7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM73Q86UV7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM73Q86UV7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRIM73Q86UV7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM73Q86UV7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRIM73Q86UV7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRIM73Q86UV7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM73Q86UV7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM73Q86UV7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TRIM73Q86UV7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TRIM73Q86UV7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM73Q86UV7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIM73Q86UV7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM73Q86UV7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM73Q86UV7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM73Q86UV7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM73Q86UV7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIM73Q86UV7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM73Q86UV7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIM73Q86UV7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM73Q86UV7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIM73Q86UV7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIM73Q86UV7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM73Q86UV7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM73Q86UV7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM73Q86UV7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM73Q86UV7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms