Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVM7

TOM1L2, TOM1-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1L2Q6ZVM7 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
TOM1L2Q6ZVM7 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
TOM1L2Q6ZVM7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
TOM1L2Q6ZVM7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC36.82■■■■□ 3.48
TOM1L2Q6ZVM7 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
TOM1L2Q6ZVM7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
TOM1L2Q6ZVM7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
TOM1L2Q6ZVM7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
TOM1L2Q6ZVM7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
TOM1L2Q6ZVM7 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC36.76■■■■□ 3.48
TOM1L2Q6ZVM7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
TOM1L2Q6ZVM7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
TOM1L2Q6ZVM7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
TOM1L2Q6ZVM7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
TOM1L2Q6ZVM7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
TOM1L2Q6ZVM7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
TOM1L2Q6ZVM7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
TOM1L2Q6ZVM7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC36.7■■■■□ 3.47
TOM1L2Q6ZVM7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
TOM1L2Q6ZVM7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
TOM1L2Q6ZVM7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
TOM1L2Q6ZVM7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
TOM1L2Q6ZVM7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC36.66■■■■□ 3.46
TOM1L2Q6ZVM7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC36.66■■■■□ 3.46
TOM1L2Q6ZVM7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
TOM1L2Q6ZVM7 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
TOM1L2Q6ZVM7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
TOM1L2Q6ZVM7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
TOM1L2Q6ZVM7 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
TOM1L2Q6ZVM7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
TOM1L2Q6ZVM7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
TOM1L2Q6ZVM7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
TOM1L2Q6ZVM7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
TOM1L2Q6ZVM7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
TOM1L2Q6ZVM7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.57■■■■□ 3.44
TOM1L2Q6ZVM7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
TOM1L2Q6ZVM7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
TOM1L2Q6ZVM7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
TOM1L2Q6ZVM7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
TOM1L2Q6ZVM7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC36.55■■■■□ 3.44
TOM1L2Q6ZVM7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
TOM1L2Q6ZVM7 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
TOM1L2Q6ZVM7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
TOM1L2Q6ZVM7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
TOM1L2Q6ZVM7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC36.5■■■■□ 3.43
TOM1L2Q6ZVM7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
TOM1L2Q6ZVM7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
TOM1L2Q6ZVM7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
TOM1L2Q6ZVM7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
TOM1L2Q6ZVM7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
TOM1L2Q6ZVM7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
TOM1L2Q6ZVM7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
TOM1L2Q6ZVM7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
TOM1L2Q6ZVM7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
TOM1L2Q6ZVM7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
TOM1L2Q6ZVM7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
TOM1L2Q6ZVM7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
TOM1L2Q6ZVM7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
TOM1L2Q6ZVM7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC36.38■■■■□ 3.41
TOM1L2Q6ZVM7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
TOM1L2Q6ZVM7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
TOM1L2Q6ZVM7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
TOM1L2Q6ZVM7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
TOM1L2Q6ZVM7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC36.33■■■■□ 3.41
TOM1L2Q6ZVM7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC36.3■■■■□ 3.4
TOM1L2Q6ZVM7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
TOM1L2Q6ZVM7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
TOM1L2Q6ZVM7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC36.27■■■■□ 3.4
TOM1L2Q6ZVM7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
TOM1L2Q6ZVM7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
TOM1L2Q6ZVM7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
TOM1L2Q6ZVM7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
TOM1L2Q6ZVM7 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.39
TOM1L2Q6ZVM7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
TOM1L2Q6ZVM7 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
TOM1L2Q6ZVM7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
TOM1L2Q6ZVM7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
TOM1L2Q6ZVM7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
TOM1L2Q6ZVM7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
TOM1L2Q6ZVM7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
TOM1L2Q6ZVM7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
TOM1L2Q6ZVM7 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
TOM1L2Q6ZVM7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
TOM1L2Q6ZVM7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC36.18■■■■□ 3.38
TOM1L2Q6ZVM7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
TOM1L2Q6ZVM7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC36.17■■■■□ 3.38
TOM1L2Q6ZVM7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
TOM1L2Q6ZVM7 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
TOM1L2Q6ZVM7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
TOM1L2Q6ZVM7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
TOM1L2Q6ZVM7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC36.14■■■■□ 3.38
TOM1L2Q6ZVM7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
TOM1L2Q6ZVM7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
TOM1L2Q6ZVM7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
TOM1L2Q6ZVM7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
TOM1L2Q6ZVM7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
TOM1L2Q6ZVM7 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
TOM1L2Q6ZVM7 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
TOM1L2Q6ZVM7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
TOM1L2Q6ZVM7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms