Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSA7

LRRC55, Leucine-rich repeat-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC55Q6ZSA7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
LRRC55Q6ZSA7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
LRRC55Q6ZSA7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
LRRC55Q6ZSA7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
LRRC55Q6ZSA7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
LRRC55Q6ZSA7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
LRRC55Q6ZSA7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
LRRC55Q6ZSA7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
LRRC55Q6ZSA7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
LRRC55Q6ZSA7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
LRRC55Q6ZSA7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
LRRC55Q6ZSA7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
LRRC55Q6ZSA7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
LRRC55Q6ZSA7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
LRRC55Q6ZSA7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
LRRC55Q6ZSA7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
LRRC55Q6ZSA7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
LRRC55Q6ZSA7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
LRRC55Q6ZSA7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
LRRC55Q6ZSA7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
LRRC55Q6ZSA7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
LRRC55Q6ZSA7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
LRRC55Q6ZSA7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
LRRC55Q6ZSA7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
LRRC55Q6ZSA7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
LRRC55Q6ZSA7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
LRRC55Q6ZSA7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
LRRC55Q6ZSA7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
LRRC55Q6ZSA7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
LRRC55Q6ZSA7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
LRRC55Q6ZSA7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
LRRC55Q6ZSA7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
LRRC55Q6ZSA7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
LRRC55Q6ZSA7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
LRRC55Q6ZSA7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
LRRC55Q6ZSA7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
LRRC55Q6ZSA7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
LRRC55Q6ZSA7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
LRRC55Q6ZSA7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
LRRC55Q6ZSA7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
LRRC55Q6ZSA7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
LRRC55Q6ZSA7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
LRRC55Q6ZSA7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
LRRC55Q6ZSA7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
LRRC55Q6ZSA7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
LRRC55Q6ZSA7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
LRRC55Q6ZSA7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
LRRC55Q6ZSA7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC30.06■■■□□ 2.4
LRRC55Q6ZSA7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
LRRC55Q6ZSA7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
LRRC55Q6ZSA7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
LRRC55Q6ZSA7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
LRRC55Q6ZSA7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
LRRC55Q6ZSA7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
LRRC55Q6ZSA7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
LRRC55Q6ZSA7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
LRRC55Q6ZSA7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
LRRC55Q6ZSA7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
LRRC55Q6ZSA7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
LRRC55Q6ZSA7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
LRRC55Q6ZSA7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
LRRC55Q6ZSA7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
LRRC55Q6ZSA7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
LRRC55Q6ZSA7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC30■■■□□ 2.39
LRRC55Q6ZSA7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
LRRC55Q6ZSA7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
LRRC55Q6ZSA7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
LRRC55Q6ZSA7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
LRRC55Q6ZSA7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
LRRC55Q6ZSA7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
LRRC55Q6ZSA7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
LRRC55Q6ZSA7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
LRRC55Q6ZSA7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
LRRC55Q6ZSA7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
LRRC55Q6ZSA7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
LRRC55Q6ZSA7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
LRRC55Q6ZSA7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
LRRC55Q6ZSA7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
LRRC55Q6ZSA7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
LRRC55Q6ZSA7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
LRRC55Q6ZSA7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
LRRC55Q6ZSA7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
LRRC55Q6ZSA7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
LRRC55Q6ZSA7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
LRRC55Q6ZSA7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
LRRC55Q6ZSA7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
LRRC55Q6ZSA7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
LRRC55Q6ZSA7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
LRRC55Q6ZSA7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
LRRC55Q6ZSA7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
LRRC55Q6ZSA7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
LRRC55Q6ZSA7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
LRRC55Q6ZSA7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
LRRC55Q6ZSA7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
LRRC55Q6ZSA7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
LRRC55Q6ZSA7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
LRRC55Q6ZSA7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
LRRC55Q6ZSA7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
LRRC55Q6ZSA7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
LRRC55Q6ZSA7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms