Protein–RNA interactions for Protein: Q6XPR3

RPTN, Repetin, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPTNQ6XPR3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPTNQ6XPR3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPTNQ6XPR3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPTNQ6XPR3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPTNQ6XPR3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPTNQ6XPR3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPTNQ6XPR3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPTNQ6XPR3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPTNQ6XPR3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RPTNQ6XPR3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RPTNQ6XPR3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RPTNQ6XPR3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPTNQ6XPR3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPTNQ6XPR3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPTNQ6XPR3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RPTNQ6XPR3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPTNQ6XPR3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPTNQ6XPR3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPTNQ6XPR3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPTNQ6XPR3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPTNQ6XPR3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPTNQ6XPR3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPTNQ6XPR3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RPTNQ6XPR3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPTNQ6XPR3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPTNQ6XPR3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPTNQ6XPR3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPTNQ6XPR3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPTNQ6XPR3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPTNQ6XPR3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPTNQ6XPR3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPTNQ6XPR3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPTNQ6XPR3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPTNQ6XPR3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RPTNQ6XPR3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPTNQ6XPR3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPTNQ6XPR3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RPTNQ6XPR3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPTNQ6XPR3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPTNQ6XPR3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPTNQ6XPR3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPTNQ6XPR3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPTNQ6XPR3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPTNQ6XPR3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPTNQ6XPR3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPTNQ6XPR3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPTNQ6XPR3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPTNQ6XPR3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPTNQ6XPR3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPTNQ6XPR3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPTNQ6XPR3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPTNQ6XPR3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPTNQ6XPR3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPTNQ6XPR3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPTNQ6XPR3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPTNQ6XPR3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPTNQ6XPR3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPTNQ6XPR3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPTNQ6XPR3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPTNQ6XPR3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPTNQ6XPR3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPTNQ6XPR3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPTNQ6XPR3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPTNQ6XPR3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPTNQ6XPR3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RPTNQ6XPR3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPTNQ6XPR3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RPTNQ6XPR3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPTNQ6XPR3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPTNQ6XPR3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPTNQ6XPR3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPTNQ6XPR3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPTNQ6XPR3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPTNQ6XPR3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPTNQ6XPR3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPTNQ6XPR3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPTNQ6XPR3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPTNQ6XPR3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPTNQ6XPR3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RPTNQ6XPR3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPTNQ6XPR3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RPTNQ6XPR3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RPTNQ6XPR3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPTNQ6XPR3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPTNQ6XPR3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPTNQ6XPR3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPTNQ6XPR3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPTNQ6XPR3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPTNQ6XPR3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPTNQ6XPR3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPTNQ6XPR3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RPTNQ6XPR3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPTNQ6XPR3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPTNQ6XPR3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPTNQ6XPR3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RPTNQ6XPR3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPTNQ6XPR3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RPTNQ6XPR3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPTNQ6XPR3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPTNQ6XPR3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms