Protein–RNA interactions for Protein: Q6W349

LINC00575, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00575, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00575Q6W349 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00575Q6W349 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00575Q6W349 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00575Q6W349 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00575Q6W349 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00575Q6W349 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00575Q6W349 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00575Q6W349 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00575Q6W349 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00575Q6W349 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00575Q6W349 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00575Q6W349 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00575Q6W349 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00575Q6W349 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00575Q6W349 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00575Q6W349 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00575Q6W349 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00575Q6W349 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00575Q6W349 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00575Q6W349 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00575Q6W349 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00575Q6W349 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00575Q6W349 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00575Q6W349 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00575Q6W349 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00575Q6W349 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00575Q6W349 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00575Q6W349 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00575Q6W349 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00575Q6W349 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00575Q6W349 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00575Q6W349 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00575Q6W349 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00575Q6W349 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00575Q6W349 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00575Q6W349 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00575Q6W349 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00575Q6W349 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00575Q6W349 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00575Q6W349 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00575Q6W349 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00575Q6W349 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00575Q6W349 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00575Q6W349 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00575Q6W349 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00575Q6W349 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00575Q6W349 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00575Q6W349 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00575Q6W349 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00575Q6W349 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00575Q6W349 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LINC00575Q6W349 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00575Q6W349 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00575Q6W349 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00575Q6W349 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00575Q6W349 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00575Q6W349 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00575Q6W349 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00575Q6W349 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00575Q6W349 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00575Q6W349 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00575Q6W349 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00575Q6W349 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00575Q6W349 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00575Q6W349 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00575Q6W349 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00575Q6W349 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00575Q6W349 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00575Q6W349 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00575Q6W349 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00575Q6W349 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00575Q6W349 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00575Q6W349 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LINC00575Q6W349 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00575Q6W349 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00575Q6W349 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00575Q6W349 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00575Q6W349 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00575Q6W349 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00575Q6W349 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00575Q6W349 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00575Q6W349 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00575Q6W349 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00575Q6W349 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00575Q6W349 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00575Q6W349 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00575Q6W349 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00575Q6W349 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00575Q6W349 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00575Q6W349 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00575Q6W349 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00575Q6W349 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00575Q6W349 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00575Q6W349 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00575Q6W349 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00575Q6W349 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00575Q6W349 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00575Q6W349 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00575Q6W349 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00575Q6W349 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms