Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWJ1

TMCO3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO3Q6UWJ1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TMCO3Q6UWJ1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TMCO3Q6UWJ1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TMCO3Q6UWJ1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TMCO3Q6UWJ1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TMCO3Q6UWJ1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TMCO3Q6UWJ1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TMCO3Q6UWJ1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.24
TMCO3Q6UWJ1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TMCO3Q6UWJ1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TMCO3Q6UWJ1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TMCO3Q6UWJ1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TMCO3Q6UWJ1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TMCO3Q6UWJ1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TMCO3Q6UWJ1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TMCO3Q6UWJ1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TMCO3Q6UWJ1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TMCO3Q6UWJ1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TMCO3Q6UWJ1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TMCO3Q6UWJ1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TMCO3Q6UWJ1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TMCO3Q6UWJ1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TMCO3Q6UWJ1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TMCO3Q6UWJ1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TMCO3Q6UWJ1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TMCO3Q6UWJ1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TMCO3Q6UWJ1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TMCO3Q6UWJ1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TMCO3Q6UWJ1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TMCO3Q6UWJ1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TMCO3Q6UWJ1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TMCO3Q6UWJ1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TMCO3Q6UWJ1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TMCO3Q6UWJ1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TMCO3Q6UWJ1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TMCO3Q6UWJ1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TMCO3Q6UWJ1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TMCO3Q6UWJ1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
TMCO3Q6UWJ1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TMCO3Q6UWJ1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TMCO3Q6UWJ1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TMCO3Q6UWJ1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TMCO3Q6UWJ1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
TMCO3Q6UWJ1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.21
TMCO3Q6UWJ1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TMCO3Q6UWJ1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TMCO3Q6UWJ1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TMCO3Q6UWJ1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TMCO3Q6UWJ1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TMCO3Q6UWJ1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TMCO3Q6UWJ1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TMCO3Q6UWJ1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TMCO3Q6UWJ1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TMCO3Q6UWJ1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TMCO3Q6UWJ1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TMCO3Q6UWJ1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TMCO3Q6UWJ1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TMCO3Q6UWJ1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TMCO3Q6UWJ1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TMCO3Q6UWJ1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TMCO3Q6UWJ1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TMCO3Q6UWJ1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TMCO3Q6UWJ1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TMCO3Q6UWJ1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TMCO3Q6UWJ1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TMCO3Q6UWJ1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TMCO3Q6UWJ1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TMCO3Q6UWJ1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TMCO3Q6UWJ1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TMCO3Q6UWJ1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TMCO3Q6UWJ1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TMCO3Q6UWJ1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TMCO3Q6UWJ1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
TMCO3Q6UWJ1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TMCO3Q6UWJ1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TMCO3Q6UWJ1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TMCO3Q6UWJ1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TMCO3Q6UWJ1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TMCO3Q6UWJ1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TMCO3Q6UWJ1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TMCO3Q6UWJ1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TMCO3Q6UWJ1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TMCO3Q6UWJ1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TMCO3Q6UWJ1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TMCO3Q6UWJ1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TMCO3Q6UWJ1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TMCO3Q6UWJ1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TMCO3Q6UWJ1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TMCO3Q6UWJ1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TMCO3Q6UWJ1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TMCO3Q6UWJ1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TMCO3Q6UWJ1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TMCO3Q6UWJ1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TMCO3Q6UWJ1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TMCO3Q6UWJ1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TMCO3Q6UWJ1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TMCO3Q6UWJ1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TMCO3Q6UWJ1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TMCO3Q6UWJ1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TMCO3Q6UWJ1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms