Protein–RNA interactions for Protein: Q69YN4

VIRMA, Protein virilizer homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIRMAQ69YN4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
VIRMAQ69YN4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
VIRMAQ69YN4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
VIRMAQ69YN4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC35.81■■■■□ 3.32
VIRMAQ69YN4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
VIRMAQ69YN4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
VIRMAQ69YN4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC35.8■■■■□ 3.32
VIRMAQ69YN4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
VIRMAQ69YN4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
VIRMAQ69YN4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
VIRMAQ69YN4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
VIRMAQ69YN4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC35.78■■■■□ 3.32
VIRMAQ69YN4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC35.77■■■■□ 3.32
VIRMAQ69YN4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
VIRMAQ69YN4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
VIRMAQ69YN4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
VIRMAQ69YN4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
VIRMAQ69YN4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
VIRMAQ69YN4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
VIRMAQ69YN4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
VIRMAQ69YN4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
VIRMAQ69YN4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
VIRMAQ69YN4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
VIRMAQ69YN4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC35.68■■■■□ 3.3
VIRMAQ69YN4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
VIRMAQ69YN4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
VIRMAQ69YN4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
VIRMAQ69YN4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
VIRMAQ69YN4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
VIRMAQ69YN4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
VIRMAQ69YN4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
VIRMAQ69YN4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
VIRMAQ69YN4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
VIRMAQ69YN4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
VIRMAQ69YN4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
VIRMAQ69YN4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
VIRMAQ69YN4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
VIRMAQ69YN4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
VIRMAQ69YN4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
VIRMAQ69YN4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
VIRMAQ69YN4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
VIRMAQ69YN4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
VIRMAQ69YN4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
VIRMAQ69YN4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
VIRMAQ69YN4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
VIRMAQ69YN4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
VIRMAQ69YN4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
VIRMAQ69YN4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
VIRMAQ69YN4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC35.56■■■■□ 3.28
VIRMAQ69YN4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
VIRMAQ69YN4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
VIRMAQ69YN4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
VIRMAQ69YN4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
VIRMAQ69YN4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
VIRMAQ69YN4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
VIRMAQ69YN4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
VIRMAQ69YN4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
VIRMAQ69YN4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC35.52■■■■□ 3.28
VIRMAQ69YN4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
VIRMAQ69YN4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
VIRMAQ69YN4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.5■■■■□ 3.27
VIRMAQ69YN4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
VIRMAQ69YN4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
VIRMAQ69YN4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC35.48■■■■□ 3.27
VIRMAQ69YN4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
VIRMAQ69YN4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
VIRMAQ69YN4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
VIRMAQ69YN4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
VIRMAQ69YN4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
VIRMAQ69YN4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
VIRMAQ69YN4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
VIRMAQ69YN4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
VIRMAQ69YN4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
VIRMAQ69YN4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
VIRMAQ69YN4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
VIRMAQ69YN4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC35.43■■■■□ 3.26
VIRMAQ69YN4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
VIRMAQ69YN4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
VIRMAQ69YN4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
VIRMAQ69YN4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.26
VIRMAQ69YN4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
VIRMAQ69YN4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
VIRMAQ69YN4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC35.37■■■■□ 3.25
VIRMAQ69YN4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
VIRMAQ69YN4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
VIRMAQ69YN4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
VIRMAQ69YN4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
VIRMAQ69YN4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
VIRMAQ69YN4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
VIRMAQ69YN4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
VIRMAQ69YN4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
VIRMAQ69YN4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
VIRMAQ69YN4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
VIRMAQ69YN4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
VIRMAQ69YN4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
VIRMAQ69YN4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.25
VIRMAQ69YN4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
VIRMAQ69YN4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
VIRMAQ69YN4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
VIRMAQ69YN4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms