Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
AGAP9Q5VTM2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
AGAP9Q5VTM2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
AGAP9Q5VTM2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
AGAP9Q5VTM2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
AGAP9Q5VTM2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
AGAP9Q5VTM2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
AGAP9Q5VTM2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
AGAP9Q5VTM2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
AGAP9Q5VTM2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
AGAP9Q5VTM2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
AGAP9Q5VTM2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
AGAP9Q5VTM2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
AGAP9Q5VTM2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
AGAP9Q5VTM2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
AGAP9Q5VTM2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
AGAP9Q5VTM2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
AGAP9Q5VTM2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
AGAP9Q5VTM2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
AGAP9Q5VTM2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
AGAP9Q5VTM2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
AGAP9Q5VTM2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
AGAP9Q5VTM2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
AGAP9Q5VTM2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
AGAP9Q5VTM2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
AGAP9Q5VTM2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
AGAP9Q5VTM2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
AGAP9Q5VTM2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
AGAP9Q5VTM2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
AGAP9Q5VTM2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
AGAP9Q5VTM2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
AGAP9Q5VTM2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
AGAP9Q5VTM2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
AGAP9Q5VTM2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
AGAP9Q5VTM2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
AGAP9Q5VTM2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
AGAP9Q5VTM2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
AGAP9Q5VTM2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
AGAP9Q5VTM2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
AGAP9Q5VTM2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
AGAP9Q5VTM2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
AGAP9Q5VTM2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
AGAP9Q5VTM2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
AGAP9Q5VTM2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
AGAP9Q5VTM2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
AGAP9Q5VTM2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
AGAP9Q5VTM2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
AGAP9Q5VTM2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
AGAP9Q5VTM2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
AGAP9Q5VTM2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
AGAP9Q5VTM2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
AGAP9Q5VTM2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
AGAP9Q5VTM2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
AGAP9Q5VTM2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
AGAP9Q5VTM2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
AGAP9Q5VTM2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
AGAP9Q5VTM2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
AGAP9Q5VTM2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
AGAP9Q5VTM2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
AGAP9Q5VTM2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
AGAP9Q5VTM2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
AGAP9Q5VTM2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
AGAP9Q5VTM2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
AGAP9Q5VTM2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
AGAP9Q5VTM2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
AGAP9Q5VTM2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
AGAP9Q5VTM2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
AGAP9Q5VTM2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
AGAP9Q5VTM2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
AGAP9Q5VTM2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
AGAP9Q5VTM2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
AGAP9Q5VTM2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
AGAP9Q5VTM2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
AGAP9Q5VTM2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
AGAP9Q5VTM2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
AGAP9Q5VTM2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
AGAP9Q5VTM2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
AGAP9Q5VTM2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
AGAP9Q5VTM2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
AGAP9Q5VTM2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
AGAP9Q5VTM2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
AGAP9Q5VTM2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
AGAP9Q5VTM2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
AGAP9Q5VTM2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
AGAP9Q5VTM2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
AGAP9Q5VTM2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
AGAP9Q5VTM2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
AGAP9Q5VTM2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
AGAP9Q5VTM2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
AGAP9Q5VTM2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
AGAP9Q5VTM2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
AGAP9Q5VTM2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
AGAP9Q5VTM2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
AGAP9Q5VTM2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
AGAP9Q5VTM2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
AGAP9Q5VTM2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
AGAP9Q5VTM2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
AGAP9Q5VTM2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
AGAP9Q5VTM2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
AGAP9Q5VTM2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151 ms