Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL7

FNDC7, Fibronectin type III domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC7Q5VTL7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FNDC7Q5VTL7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
FNDC7Q5VTL7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FNDC7Q5VTL7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FNDC7Q5VTL7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FNDC7Q5VTL7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FNDC7Q5VTL7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
FNDC7Q5VTL7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FNDC7Q5VTL7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FNDC7Q5VTL7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FNDC7Q5VTL7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FNDC7Q5VTL7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FNDC7Q5VTL7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FNDC7Q5VTL7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FNDC7Q5VTL7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FNDC7Q5VTL7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
FNDC7Q5VTL7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
FNDC7Q5VTL7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25■■□□□ 1.59
FNDC7Q5VTL7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FNDC7Q5VTL7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FNDC7Q5VTL7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FNDC7Q5VTL7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FNDC7Q5VTL7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FNDC7Q5VTL7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FNDC7Q5VTL7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FNDC7Q5VTL7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FNDC7Q5VTL7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FNDC7Q5VTL7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FNDC7Q5VTL7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FNDC7Q5VTL7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FNDC7Q5VTL7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FNDC7Q5VTL7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FNDC7Q5VTL7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FNDC7Q5VTL7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FNDC7Q5VTL7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FNDC7Q5VTL7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FNDC7Q5VTL7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FNDC7Q5VTL7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FNDC7Q5VTL7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FNDC7Q5VTL7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FNDC7Q5VTL7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FNDC7Q5VTL7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FNDC7Q5VTL7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FNDC7Q5VTL7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FNDC7Q5VTL7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FNDC7Q5VTL7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FNDC7Q5VTL7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FNDC7Q5VTL7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FNDC7Q5VTL7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FNDC7Q5VTL7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
FNDC7Q5VTL7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FNDC7Q5VTL7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FNDC7Q5VTL7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FNDC7Q5VTL7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FNDC7Q5VTL7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FNDC7Q5VTL7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FNDC7Q5VTL7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FNDC7Q5VTL7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FNDC7Q5VTL7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FNDC7Q5VTL7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FNDC7Q5VTL7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FNDC7Q5VTL7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FNDC7Q5VTL7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FNDC7Q5VTL7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FNDC7Q5VTL7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FNDC7Q5VTL7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FNDC7Q5VTL7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FNDC7Q5VTL7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FNDC7Q5VTL7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FNDC7Q5VTL7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FNDC7Q5VTL7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FNDC7Q5VTL7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FNDC7Q5VTL7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FNDC7Q5VTL7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FNDC7Q5VTL7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FNDC7Q5VTL7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FNDC7Q5VTL7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FNDC7Q5VTL7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FNDC7Q5VTL7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FNDC7Q5VTL7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FNDC7Q5VTL7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FNDC7Q5VTL7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FNDC7Q5VTL7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FNDC7Q5VTL7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
FNDC7Q5VTL7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
FNDC7Q5VTL7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FNDC7Q5VTL7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FNDC7Q5VTL7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FNDC7Q5VTL7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FNDC7Q5VTL7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FNDC7Q5VTL7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FNDC7Q5VTL7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FNDC7Q5VTL7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FNDC7Q5VTL7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FNDC7Q5VTL7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FNDC7Q5VTL7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FNDC7Q5VTL7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FNDC7Q5VTL7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FNDC7Q5VTL7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FNDC7Q5VTL7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms