Protein–RNA interactions for Protein: Q5T890

ERCC6L2, DNA excision repair protein ERCC-6-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6L2Q5T890 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.97■■■■■ 4.79
ERCC6L2Q5T890 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC44.95■■■■■ 4.79
ERCC6L2Q5T890 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.95■■■■■ 4.79
ERCC6L2Q5T890 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC44.92■■■■■ 4.78
ERCC6L2Q5T890 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC44.91■■■■■ 4.78
ERCC6L2Q5T890 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.89■■■■■ 4.78
ERCC6L2Q5T890 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC44.88■■■■■ 4.78
ERCC6L2Q5T890 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.88■■■■■ 4.78
ERCC6L2Q5T890 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC44.87■■■■■ 4.77
ERCC6L2Q5T890 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC44.86■■■■■ 4.77
ERCC6L2Q5T890 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.85■■■■■ 4.77
ERCC6L2Q5T890 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC44.83■■■■■ 4.77
ERCC6L2Q5T890 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.82■■■■■ 4.76
ERCC6L2Q5T890 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.82■■■■■ 4.76
ERCC6L2Q5T890 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC44.8■■■■■ 4.76
ERCC6L2Q5T890 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.78■■■■■ 4.76
ERCC6L2Q5T890 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.78■■■■■ 4.76
ERCC6L2Q5T890 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC44.72■■■■■ 4.75
ERCC6L2Q5T890 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC44.7■■■■■ 4.75
ERCC6L2Q5T890 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC44.69■■■■■ 4.75
ERCC6L2Q5T890 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.69■■■■■ 4.75
ERCC6L2Q5T890 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.68■■■■■ 4.74
ERCC6L2Q5T890 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC44.67■■■■■ 4.74
ERCC6L2Q5T890 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.67■■■■■ 4.74
ERCC6L2Q5T890 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC44.66■■■■■ 4.74
ERCC6L2Q5T890 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC44.65■■■■■ 4.74
ERCC6L2Q5T890 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC44.65■■■■■ 4.74
ERCC6L2Q5T890 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC44.64■■■■■ 4.74
ERCC6L2Q5T890 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC44.64■■■■■ 4.74
ERCC6L2Q5T890 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC44.64■■■■■ 4.74
ERCC6L2Q5T890 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC44.64■■■■■ 4.74
ERCC6L2Q5T890 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC44.64■■■■■ 4.74
ERCC6L2Q5T890 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC44.64■■■■■ 4.74
ERCC6L2Q5T890 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.62■■■■■ 4.73
ERCC6L2Q5T890 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC44.62■■■■■ 4.73
ERCC6L2Q5T890 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC44.61■■■■■ 4.73
ERCC6L2Q5T890 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC44.61■■■■■ 4.73
ERCC6L2Q5T890 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC44.61■■■■■ 4.73
ERCC6L2Q5T890 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC44.59■■■■■ 4.73
ERCC6L2Q5T890 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC44.59■■■■■ 4.73
ERCC6L2Q5T890 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC44.58■■■■■ 4.73
ERCC6L2Q5T890 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC44.57■■■■■ 4.73
ERCC6L2Q5T890 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.56■■■■■ 4.72
ERCC6L2Q5T890 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.54■■■■■ 4.72
ERCC6L2Q5T890 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
ERCC6L2Q5T890 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC44.52■■■■■ 4.72
ERCC6L2Q5T890 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.49■■■■■ 4.71
ERCC6L2Q5T890 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.49■■■■■ 4.71
ERCC6L2Q5T890 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.49■■■■■ 4.71
ERCC6L2Q5T890 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.49■■■■■ 4.71
ERCC6L2Q5T890 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC44.48■■■■■ 4.71
ERCC6L2Q5T890 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.46■■■■■ 4.71
ERCC6L2Q5T890 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.44■■■■■ 4.71
ERCC6L2Q5T890 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC44.43■■■■■ 4.7
ERCC6L2Q5T890 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC44.42■■■■■ 4.7
ERCC6L2Q5T890 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC44.42■■■■■ 4.7
ERCC6L2Q5T890 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.4■■■■■ 4.7
ERCC6L2Q5T890 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.69
ERCC6L2Q5T890 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.69
ERCC6L2Q5T890 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC44.35■■■■■ 4.69
ERCC6L2Q5T890 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.35■■■■■ 4.69
ERCC6L2Q5T890 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC44.35■■■■■ 4.69
ERCC6L2Q5T890 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC44.35■■■■■ 4.69
ERCC6L2Q5T890 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.34■■■■■ 4.69
ERCC6L2Q5T890 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC44.31■■■■■ 4.68
ERCC6L2Q5T890 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.31■■■■■ 4.68
ERCC6L2Q5T890 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC44.28■■■■■ 4.68
ERCC6L2Q5T890 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.28■■■■■ 4.68
ERCC6L2Q5T890 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
ERCC6L2Q5T890 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
ERCC6L2Q5T890 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.26■■■■■ 4.68
ERCC6L2Q5T890 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC44.26■■■■■ 4.68
ERCC6L2Q5T890 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.26■■■■■ 4.68
ERCC6L2Q5T890 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
ERCC6L2Q5T890 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC44.25■■■■■ 4.67
ERCC6L2Q5T890 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC44.25■■■■■ 4.67
ERCC6L2Q5T890 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC44.25■■■■■ 4.67
ERCC6L2Q5T890 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
ERCC6L2Q5T890 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
ERCC6L2Q5T890 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
ERCC6L2Q5T890 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC44.19■■■■■ 4.66
ERCC6L2Q5T890 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC44.19■■■■■ 4.66
ERCC6L2Q5T890 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC44.18■■■■■ 4.66
ERCC6L2Q5T890 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.17■■■■■ 4.66
ERCC6L2Q5T890 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC44.17■■■■■ 4.66
ERCC6L2Q5T890 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.14■■■■■ 4.66
ERCC6L2Q5T890 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC44.14■■■■■ 4.66
ERCC6L2Q5T890 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC44.14■■■■■ 4.66
ERCC6L2Q5T890 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC44.14■■■■■ 4.66
ERCC6L2Q5T890 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC44.13■■■■■ 4.65
ERCC6L2Q5T890 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC44.13■■■■■ 4.65
ERCC6L2Q5T890 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.1■■■■■ 4.65
ERCC6L2Q5T890 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC44.1■■■■■ 4.65
ERCC6L2Q5T890 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC44.09■■■■■ 4.65
ERCC6L2Q5T890 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC44.07■■■■■ 4.65
ERCC6L2Q5T890 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.07■■■■■ 4.65
ERCC6L2Q5T890 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
ERCC6L2Q5T890 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
ERCC6L2Q5T890 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC44.06■■■■■ 4.64
ERCC6L2Q5T890 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.05■■■■■ 4.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms