Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4T6

SYCP2L, Synaptonemal complex protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2LQ5T4T6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SYCP2LQ5T4T6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SYCP2LQ5T4T6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYCP2LQ5T4T6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYCP2LQ5T4T6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYCP2LQ5T4T6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYCP2LQ5T4T6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYCP2LQ5T4T6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SYCP2LQ5T4T6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SYCP2LQ5T4T6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SYCP2LQ5T4T6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SYCP2LQ5T4T6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SYCP2LQ5T4T6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SYCP2LQ5T4T6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SYCP2LQ5T4T6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SYCP2LQ5T4T6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SYCP2LQ5T4T6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SYCP2LQ5T4T6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SYCP2LQ5T4T6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SYCP2LQ5T4T6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SYCP2LQ5T4T6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SYCP2LQ5T4T6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SYCP2LQ5T4T6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SYCP2LQ5T4T6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYCP2LQ5T4T6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYCP2LQ5T4T6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYCP2LQ5T4T6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SYCP2LQ5T4T6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SYCP2LQ5T4T6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SYCP2LQ5T4T6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SYCP2LQ5T4T6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SYCP2LQ5T4T6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYCP2LQ5T4T6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYCP2LQ5T4T6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYCP2LQ5T4T6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SYCP2LQ5T4T6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SYCP2LQ5T4T6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SYCP2LQ5T4T6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SYCP2LQ5T4T6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SYCP2LQ5T4T6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYCP2LQ5T4T6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SYCP2LQ5T4T6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SYCP2LQ5T4T6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SYCP2LQ5T4T6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SYCP2LQ5T4T6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SYCP2LQ5T4T6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYCP2LQ5T4T6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYCP2LQ5T4T6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYCP2LQ5T4T6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SYCP2LQ5T4T6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SYCP2LQ5T4T6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SYCP2LQ5T4T6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SYCP2LQ5T4T6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SYCP2LQ5T4T6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SYCP2LQ5T4T6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SYCP2LQ5T4T6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYCP2LQ5T4T6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYCP2LQ5T4T6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYCP2LQ5T4T6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYCP2LQ5T4T6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYCP2LQ5T4T6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SYCP2LQ5T4T6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SYCP2LQ5T4T6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYCP2LQ5T4T6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYCP2LQ5T4T6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYCP2LQ5T4T6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SYCP2LQ5T4T6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYCP2LQ5T4T6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYCP2LQ5T4T6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYCP2LQ5T4T6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYCP2LQ5T4T6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYCP2LQ5T4T6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYCP2LQ5T4T6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYCP2LQ5T4T6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYCP2LQ5T4T6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYCP2LQ5T4T6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYCP2LQ5T4T6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYCP2LQ5T4T6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SYCP2LQ5T4T6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SYCP2LQ5T4T6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SYCP2LQ5T4T6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SYCP2LQ5T4T6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SYCP2LQ5T4T6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SYCP2LQ5T4T6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SYCP2LQ5T4T6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SYCP2LQ5T4T6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SYCP2LQ5T4T6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SYCP2LQ5T4T6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SYCP2LQ5T4T6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SYCP2LQ5T4T6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SYCP2LQ5T4T6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SYCP2LQ5T4T6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SYCP2LQ5T4T6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SYCP2LQ5T4T6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SYCP2LQ5T4T6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SYCP2LQ5T4T6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SYCP2LQ5T4T6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SYCP2LQ5T4T6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SYCP2LQ5T4T6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SYCP2LQ5T4T6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms