Protein–RNA interactions for Protein: Q5T1J5

CHCHD2P9, Putative coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein CHCHD2P9, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD2P9Q5T1J5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CHCHD2P9Q5T1J5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHCHD2P9Q5T1J5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHCHD2P9Q5T1J5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHCHD2P9Q5T1J5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CHCHD2P9Q5T1J5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHCHD2P9Q5T1J5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHCHD2P9Q5T1J5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHCHD2P9Q5T1J5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHCHD2P9Q5T1J5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHCHD2P9Q5T1J5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHCHD2P9Q5T1J5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CHCHD2P9Q5T1J5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHCHD2P9Q5T1J5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHCHD2P9Q5T1J5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHCHD2P9Q5T1J5 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHCHD2P9Q5T1J5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHCHD2P9Q5T1J5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHCHD2P9Q5T1J5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHCHD2P9Q5T1J5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHCHD2P9Q5T1J5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CHCHD2P9Q5T1J5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHCHD2P9Q5T1J5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHCHD2P9Q5T1J5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHCHD2P9Q5T1J5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHCHD2P9Q5T1J5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHCHD2P9Q5T1J5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CHCHD2P9Q5T1J5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHCHD2P9Q5T1J5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHCHD2P9Q5T1J5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHCHD2P9Q5T1J5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHCHD2P9Q5T1J5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHCHD2P9Q5T1J5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHCHD2P9Q5T1J5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHCHD2P9Q5T1J5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHCHD2P9Q5T1J5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHCHD2P9Q5T1J5 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHCHD2P9Q5T1J5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHCHD2P9Q5T1J5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHCHD2P9Q5T1J5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHCHD2P9Q5T1J5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHCHD2P9Q5T1J5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHCHD2P9Q5T1J5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHCHD2P9Q5T1J5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHCHD2P9Q5T1J5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHCHD2P9Q5T1J5 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHCHD2P9Q5T1J5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CHCHD2P9Q5T1J5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHCHD2P9Q5T1J5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CHCHD2P9Q5T1J5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CHCHD2P9Q5T1J5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHCHD2P9Q5T1J5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHCHD2P9Q5T1J5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHCHD2P9Q5T1J5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHCHD2P9Q5T1J5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHCHD2P9Q5T1J5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHCHD2P9Q5T1J5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHCHD2P9Q5T1J5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHCHD2P9Q5T1J5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHCHD2P9Q5T1J5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHCHD2P9Q5T1J5 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHCHD2P9Q5T1J5 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHCHD2P9Q5T1J5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHCHD2P9Q5T1J5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHCHD2P9Q5T1J5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHCHD2P9Q5T1J5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHCHD2P9Q5T1J5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHCHD2P9Q5T1J5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHCHD2P9Q5T1J5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHCHD2P9Q5T1J5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHCHD2P9Q5T1J5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHCHD2P9Q5T1J5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHCHD2P9Q5T1J5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHCHD2P9Q5T1J5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHCHD2P9Q5T1J5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHCHD2P9Q5T1J5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHCHD2P9Q5T1J5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHCHD2P9Q5T1J5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHCHD2P9Q5T1J5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHCHD2P9Q5T1J5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHCHD2P9Q5T1J5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHCHD2P9Q5T1J5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHCHD2P9Q5T1J5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHCHD2P9Q5T1J5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHCHD2P9Q5T1J5 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHCHD2P9Q5T1J5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHCHD2P9Q5T1J5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHCHD2P9Q5T1J5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHCHD2P9Q5T1J5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHCHD2P9Q5T1J5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHCHD2P9Q5T1J5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHCHD2P9Q5T1J5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHCHD2P9Q5T1J5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHCHD2P9Q5T1J5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CHCHD2P9Q5T1J5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHCHD2P9Q5T1J5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHCHD2P9Q5T1J5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
CHCHD2P9Q5T1J5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHCHD2P9Q5T1J5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHCHD2P9Q5T1J5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms