Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
WDR44Q5JSH3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
WDR44Q5JSH3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
WDR44Q5JSH3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
WDR44Q5JSH3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
WDR44Q5JSH3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
WDR44Q5JSH3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
WDR44Q5JSH3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
WDR44Q5JSH3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
WDR44Q5JSH3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
WDR44Q5JSH3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
WDR44Q5JSH3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
WDR44Q5JSH3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
WDR44Q5JSH3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
WDR44Q5JSH3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
WDR44Q5JSH3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
WDR44Q5JSH3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
WDR44Q5JSH3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
WDR44Q5JSH3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
WDR44Q5JSH3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
WDR44Q5JSH3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
WDR44Q5JSH3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
WDR44Q5JSH3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
WDR44Q5JSH3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
WDR44Q5JSH3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
WDR44Q5JSH3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
WDR44Q5JSH3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
WDR44Q5JSH3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
WDR44Q5JSH3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
WDR44Q5JSH3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
WDR44Q5JSH3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
WDR44Q5JSH3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
WDR44Q5JSH3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
WDR44Q5JSH3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
WDR44Q5JSH3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
WDR44Q5JSH3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
WDR44Q5JSH3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
WDR44Q5JSH3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
WDR44Q5JSH3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
WDR44Q5JSH3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
WDR44Q5JSH3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
WDR44Q5JSH3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
WDR44Q5JSH3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
WDR44Q5JSH3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
WDR44Q5JSH3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
WDR44Q5JSH3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
WDR44Q5JSH3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
WDR44Q5JSH3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
WDR44Q5JSH3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
WDR44Q5JSH3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
WDR44Q5JSH3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
WDR44Q5JSH3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
WDR44Q5JSH3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
WDR44Q5JSH3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
WDR44Q5JSH3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
WDR44Q5JSH3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
WDR44Q5JSH3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
WDR44Q5JSH3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
WDR44Q5JSH3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
WDR44Q5JSH3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
WDR44Q5JSH3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
WDR44Q5JSH3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
WDR44Q5JSH3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
WDR44Q5JSH3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
WDR44Q5JSH3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
WDR44Q5JSH3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
WDR44Q5JSH3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
WDR44Q5JSH3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
WDR44Q5JSH3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
WDR44Q5JSH3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
WDR44Q5JSH3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
WDR44Q5JSH3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
WDR44Q5JSH3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
WDR44Q5JSH3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
WDR44Q5JSH3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
WDR44Q5JSH3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
WDR44Q5JSH3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
WDR44Q5JSH3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
WDR44Q5JSH3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
WDR44Q5JSH3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
WDR44Q5JSH3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
WDR44Q5JSH3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
WDR44Q5JSH3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
WDR44Q5JSH3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
WDR44Q5JSH3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
WDR44Q5JSH3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
WDR44Q5JSH3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
WDR44Q5JSH3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
WDR44Q5JSH3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
WDR44Q5JSH3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
WDR44Q5JSH3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
WDR44Q5JSH3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
WDR44Q5JSH3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
WDR44Q5JSH3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
WDR44Q5JSH3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
WDR44Q5JSH3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
WDR44Q5JSH3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
WDR44Q5JSH3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
WDR44Q5JSH3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
WDR44Q5JSH3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms