Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
WDR44Q5JSH3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
WDR44Q5JSH3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
WDR44Q5JSH3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
WDR44Q5JSH3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
WDR44Q5JSH3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
WDR44Q5JSH3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
WDR44Q5JSH3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
WDR44Q5JSH3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
WDR44Q5JSH3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
WDR44Q5JSH3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
WDR44Q5JSH3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
WDR44Q5JSH3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
WDR44Q5JSH3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
WDR44Q5JSH3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
WDR44Q5JSH3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
WDR44Q5JSH3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
WDR44Q5JSH3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
WDR44Q5JSH3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
WDR44Q5JSH3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
WDR44Q5JSH3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
WDR44Q5JSH3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
WDR44Q5JSH3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
WDR44Q5JSH3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
WDR44Q5JSH3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
WDR44Q5JSH3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
WDR44Q5JSH3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
WDR44Q5JSH3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
WDR44Q5JSH3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
WDR44Q5JSH3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
WDR44Q5JSH3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
WDR44Q5JSH3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
WDR44Q5JSH3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
WDR44Q5JSH3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
WDR44Q5JSH3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
WDR44Q5JSH3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
WDR44Q5JSH3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
WDR44Q5JSH3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
WDR44Q5JSH3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
WDR44Q5JSH3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
WDR44Q5JSH3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
WDR44Q5JSH3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
WDR44Q5JSH3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
WDR44Q5JSH3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
WDR44Q5JSH3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
WDR44Q5JSH3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
WDR44Q5JSH3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
WDR44Q5JSH3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
WDR44Q5JSH3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
WDR44Q5JSH3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
WDR44Q5JSH3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
WDR44Q5JSH3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
WDR44Q5JSH3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
WDR44Q5JSH3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
WDR44Q5JSH3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
WDR44Q5JSH3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
WDR44Q5JSH3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
WDR44Q5JSH3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
WDR44Q5JSH3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
WDR44Q5JSH3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
WDR44Q5JSH3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
WDR44Q5JSH3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
WDR44Q5JSH3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
WDR44Q5JSH3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
WDR44Q5JSH3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
WDR44Q5JSH3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
WDR44Q5JSH3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
WDR44Q5JSH3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
WDR44Q5JSH3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
WDR44Q5JSH3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
WDR44Q5JSH3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
WDR44Q5JSH3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
WDR44Q5JSH3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
WDR44Q5JSH3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
WDR44Q5JSH3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
WDR44Q5JSH3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
WDR44Q5JSH3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
WDR44Q5JSH3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
WDR44Q5JSH3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
WDR44Q5JSH3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
WDR44Q5JSH3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
WDR44Q5JSH3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
WDR44Q5JSH3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
WDR44Q5JSH3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
WDR44Q5JSH3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
WDR44Q5JSH3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
WDR44Q5JSH3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
WDR44Q5JSH3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
WDR44Q5JSH3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
WDR44Q5JSH3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
WDR44Q5JSH3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
WDR44Q5JSH3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
WDR44Q5JSH3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
WDR44Q5JSH3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
WDR44Q5JSH3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
WDR44Q5JSH3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
WDR44Q5JSH3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
WDR44Q5JSH3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
WDR44Q5JSH3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
WDR44Q5JSH3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84 ms