Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMEM259Q4ZIN3 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMEM259Q4ZIN3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMEM259Q4ZIN3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMEM259Q4ZIN3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMEM259Q4ZIN3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMEM259Q4ZIN3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMEM259Q4ZIN3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMEM259Q4ZIN3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMEM259Q4ZIN3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMEM259Q4ZIN3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMEM259Q4ZIN3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMEM259Q4ZIN3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMEM259Q4ZIN3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMEM259Q4ZIN3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TMEM259Q4ZIN3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMEM259Q4ZIN3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMEM259Q4ZIN3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMEM259Q4ZIN3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMEM259Q4ZIN3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMEM259Q4ZIN3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMEM259Q4ZIN3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMEM259Q4ZIN3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMEM259Q4ZIN3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMEM259Q4ZIN3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMEM259Q4ZIN3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMEM259Q4ZIN3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMEM259Q4ZIN3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMEM259Q4ZIN3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMEM259Q4ZIN3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMEM259Q4ZIN3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMEM259Q4ZIN3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMEM259Q4ZIN3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMEM259Q4ZIN3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
TMEM259Q4ZIN3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMEM259Q4ZIN3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMEM259Q4ZIN3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
TMEM259Q4ZIN3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
TMEM259Q4ZIN3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMEM259Q4ZIN3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMEM259Q4ZIN3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMEM259Q4ZIN3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMEM259Q4ZIN3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMEM259Q4ZIN3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMEM259Q4ZIN3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TMEM259Q4ZIN3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMEM259Q4ZIN3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMEM259Q4ZIN3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMEM259Q4ZIN3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMEM259Q4ZIN3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMEM259Q4ZIN3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMEM259Q4ZIN3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMEM259Q4ZIN3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMEM259Q4ZIN3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
TMEM259Q4ZIN3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMEM259Q4ZIN3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMEM259Q4ZIN3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMEM259Q4ZIN3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TMEM259Q4ZIN3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TMEM259Q4ZIN3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMEM259Q4ZIN3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMEM259Q4ZIN3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMEM259Q4ZIN3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMEM259Q4ZIN3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMEM259Q4ZIN3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMEM259Q4ZIN3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMEM259Q4ZIN3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMEM259Q4ZIN3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMEM259Q4ZIN3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMEM259Q4ZIN3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMEM259Q4ZIN3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMEM259Q4ZIN3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMEM259Q4ZIN3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMEM259Q4ZIN3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMEM259Q4ZIN3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMEM259Q4ZIN3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMEM259Q4ZIN3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMEM259Q4ZIN3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMEM259Q4ZIN3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMEM259Q4ZIN3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMEM259Q4ZIN3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMEM259Q4ZIN3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
TMEM259Q4ZIN3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMEM259Q4ZIN3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMEM259Q4ZIN3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMEM259Q4ZIN3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMEM259Q4ZIN3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMEM259Q4ZIN3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMEM259Q4ZIN3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMEM259Q4ZIN3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMEM259Q4ZIN3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMEM259Q4ZIN3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMEM259Q4ZIN3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMEM259Q4ZIN3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMEM259Q4ZIN3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMEM259Q4ZIN3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMEM259Q4ZIN3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMEM259Q4ZIN3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMEM259Q4ZIN3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TMEM259Q4ZIN3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms