Protein–RNA interactions for Protein: Q494X1

FAM153C, Protein FAM153C, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM153CQ494X1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FAM153CQ494X1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
FAM153CQ494X1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FAM153CQ494X1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FAM153CQ494X1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FAM153CQ494X1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FAM153CQ494X1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FAM153CQ494X1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FAM153CQ494X1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FAM153CQ494X1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FAM153CQ494X1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FAM153CQ494X1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FAM153CQ494X1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FAM153CQ494X1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FAM153CQ494X1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FAM153CQ494X1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FAM153CQ494X1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FAM153CQ494X1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FAM153CQ494X1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FAM153CQ494X1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FAM153CQ494X1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FAM153CQ494X1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FAM153CQ494X1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FAM153CQ494X1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FAM153CQ494X1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FAM153CQ494X1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
FAM153CQ494X1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
FAM153CQ494X1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FAM153CQ494X1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FAM153CQ494X1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
FAM153CQ494X1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
FAM153CQ494X1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FAM153CQ494X1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
FAM153CQ494X1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FAM153CQ494X1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FAM153CQ494X1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FAM153CQ494X1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
FAM153CQ494X1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FAM153CQ494X1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FAM153CQ494X1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FAM153CQ494X1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FAM153CQ494X1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FAM153CQ494X1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FAM153CQ494X1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FAM153CQ494X1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FAM153CQ494X1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
FAM153CQ494X1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FAM153CQ494X1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FAM153CQ494X1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FAM153CQ494X1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FAM153CQ494X1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FAM153CQ494X1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FAM153CQ494X1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FAM153CQ494X1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FAM153CQ494X1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
FAM153CQ494X1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FAM153CQ494X1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FAM153CQ494X1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FAM153CQ494X1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FAM153CQ494X1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FAM153CQ494X1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FAM153CQ494X1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FAM153CQ494X1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FAM153CQ494X1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FAM153CQ494X1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FAM153CQ494X1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FAM153CQ494X1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FAM153CQ494X1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FAM153CQ494X1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FAM153CQ494X1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FAM153CQ494X1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FAM153CQ494X1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FAM153CQ494X1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
FAM153CQ494X1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
FAM153CQ494X1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FAM153CQ494X1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FAM153CQ494X1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FAM153CQ494X1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FAM153CQ494X1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FAM153CQ494X1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FAM153CQ494X1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FAM153CQ494X1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FAM153CQ494X1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FAM153CQ494X1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FAM153CQ494X1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
FAM153CQ494X1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
FAM153CQ494X1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FAM153CQ494X1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FAM153CQ494X1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FAM153CQ494X1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FAM153CQ494X1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FAM153CQ494X1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FAM153CQ494X1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FAM153CQ494X1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FAM153CQ494X1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FAM153CQ494X1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FAM153CQ494X1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FAM153CQ494X1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FAM153CQ494X1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FAM153CQ494X1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms