Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZCQ8

TIMM50, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM50, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM50Q3ZCQ8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TIMM50Q3ZCQ8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TIMM50Q3ZCQ8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TIMM50Q3ZCQ8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TIMM50Q3ZCQ8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TIMM50Q3ZCQ8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TIMM50Q3ZCQ8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TIMM50Q3ZCQ8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TIMM50Q3ZCQ8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TIMM50Q3ZCQ8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TIMM50Q3ZCQ8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TIMM50Q3ZCQ8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TIMM50Q3ZCQ8 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TIMM50Q3ZCQ8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TIMM50Q3ZCQ8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TIMM50Q3ZCQ8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TIMM50Q3ZCQ8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TIMM50Q3ZCQ8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TIMM50Q3ZCQ8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TIMM50Q3ZCQ8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TIMM50Q3ZCQ8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TIMM50Q3ZCQ8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TIMM50Q3ZCQ8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TIMM50Q3ZCQ8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TIMM50Q3ZCQ8 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TIMM50Q3ZCQ8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TIMM50Q3ZCQ8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TIMM50Q3ZCQ8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TIMM50Q3ZCQ8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TIMM50Q3ZCQ8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TIMM50Q3ZCQ8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TIMM50Q3ZCQ8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TIMM50Q3ZCQ8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TIMM50Q3ZCQ8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TIMM50Q3ZCQ8 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TIMM50Q3ZCQ8 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TIMM50Q3ZCQ8 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TIMM50Q3ZCQ8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TIMM50Q3ZCQ8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TIMM50Q3ZCQ8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TIMM50Q3ZCQ8 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TIMM50Q3ZCQ8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TIMM50Q3ZCQ8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TIMM50Q3ZCQ8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TIMM50Q3ZCQ8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TIMM50Q3ZCQ8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TIMM50Q3ZCQ8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TIMM50Q3ZCQ8 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TIMM50Q3ZCQ8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TIMM50Q3ZCQ8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TIMM50Q3ZCQ8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TIMM50Q3ZCQ8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TIMM50Q3ZCQ8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TIMM50Q3ZCQ8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TIMM50Q3ZCQ8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TIMM50Q3ZCQ8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TIMM50Q3ZCQ8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TIMM50Q3ZCQ8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TIMM50Q3ZCQ8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TIMM50Q3ZCQ8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TIMM50Q3ZCQ8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TIMM50Q3ZCQ8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TIMM50Q3ZCQ8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TIMM50Q3ZCQ8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TIMM50Q3ZCQ8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TIMM50Q3ZCQ8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TIMM50Q3ZCQ8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TIMM50Q3ZCQ8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TIMM50Q3ZCQ8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TIMM50Q3ZCQ8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TIMM50Q3ZCQ8 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TIMM50Q3ZCQ8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TIMM50Q3ZCQ8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TIMM50Q3ZCQ8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TIMM50Q3ZCQ8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TIMM50Q3ZCQ8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TIMM50Q3ZCQ8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TIMM50Q3ZCQ8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TIMM50Q3ZCQ8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TIMM50Q3ZCQ8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TIMM50Q3ZCQ8 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TIMM50Q3ZCQ8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TIMM50Q3ZCQ8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TIMM50Q3ZCQ8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TIMM50Q3ZCQ8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TIMM50Q3ZCQ8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TIMM50Q3ZCQ8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TIMM50Q3ZCQ8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TIMM50Q3ZCQ8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TIMM50Q3ZCQ8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TIMM50Q3ZCQ8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TIMM50Q3ZCQ8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TIMM50Q3ZCQ8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TIMM50Q3ZCQ8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TIMM50Q3ZCQ8 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TIMM50Q3ZCQ8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TIMM50Q3ZCQ8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TIMM50Q3ZCQ8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TIMM50Q3ZCQ8 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TIMM50Q3ZCQ8 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms