Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
PUM3Q15397 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
PUM3Q15397 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
PUM3Q15397 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
PUM3Q15397 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
PUM3Q15397 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
PUM3Q15397 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
PUM3Q15397 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
PUM3Q15397 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
PUM3Q15397 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PUM3Q15397 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
PUM3Q15397 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
PUM3Q15397 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
PUM3Q15397 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
PUM3Q15397 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PUM3Q15397 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
PUM3Q15397 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PUM3Q15397 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PUM3Q15397 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
PUM3Q15397 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
PUM3Q15397 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
PUM3Q15397 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
PUM3Q15397 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PUM3Q15397 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PUM3Q15397 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
PUM3Q15397 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PUM3Q15397 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PUM3Q15397 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
PUM3Q15397 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
PUM3Q15397 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
PUM3Q15397 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
PUM3Q15397 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
PUM3Q15397 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
PUM3Q15397 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
PUM3Q15397 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
PUM3Q15397 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
PUM3Q15397 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PUM3Q15397 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PUM3Q15397 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
PUM3Q15397 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
PUM3Q15397 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
PUM3Q15397 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
PUM3Q15397 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC33.24■■■□□ 2.91
PUM3Q15397 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
PUM3Q15397 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PUM3Q15397 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
PUM3Q15397 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
PUM3Q15397 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
PUM3Q15397 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PUM3Q15397 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
PUM3Q15397 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
PUM3Q15397 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PUM3Q15397 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PUM3Q15397 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PUM3Q15397 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
PUM3Q15397 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
PUM3Q15397 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PUM3Q15397 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
PUM3Q15397 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PUM3Q15397 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PUM3Q15397 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
PUM3Q15397 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PUM3Q15397 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PUM3Q15397 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
PUM3Q15397 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
PUM3Q15397 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
PUM3Q15397 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
PUM3Q15397 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
PUM3Q15397 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
PUM3Q15397 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
PUM3Q15397 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
PUM3Q15397 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
PUM3Q15397 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
PUM3Q15397 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PUM3Q15397 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PUM3Q15397 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
PUM3Q15397 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC33.02■■■□□ 2.88
PUM3Q15397 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PUM3Q15397 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
PUM3Q15397 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
PUM3Q15397 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
PUM3Q15397 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
PUM3Q15397 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PUM3Q15397 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PUM3Q15397 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PUM3Q15397 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PUM3Q15397 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PUM3Q15397 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
PUM3Q15397 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PUM3Q15397 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PUM3Q15397 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
PUM3Q15397 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
PUM3Q15397 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
PUM3Q15397 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC32.93■■■□□ 2.86
PUM3Q15397 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PUM3Q15397 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
PUM3Q15397 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PUM3Q15397 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
PUM3Q15397 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
PUM3Q15397 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
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