Protein–RNA interactions for Protein: Q15303

ERBB4, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERBB4Q15303 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
ERBB4Q15303 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
ERBB4Q15303 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
ERBB4Q15303 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
ERBB4Q15303 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
ERBB4Q15303 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
ERBB4Q15303 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
ERBB4Q15303 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
ERBB4Q15303 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
ERBB4Q15303 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
ERBB4Q15303 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
ERBB4Q15303 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
ERBB4Q15303 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
ERBB4Q15303 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
ERBB4Q15303 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
ERBB4Q15303 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
ERBB4Q15303 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
ERBB4Q15303 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
ERBB4Q15303 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
ERBB4Q15303 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
ERBB4Q15303 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
ERBB4Q15303 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
ERBB4Q15303 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
ERBB4Q15303 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
ERBB4Q15303 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
ERBB4Q15303 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
ERBB4Q15303 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
ERBB4Q15303 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
ERBB4Q15303 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
ERBB4Q15303 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.15
ERBB4Q15303 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.15
ERBB4Q15303 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
ERBB4Q15303 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
ERBB4Q15303 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
ERBB4Q15303 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
ERBB4Q15303 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC34.74■■■■□ 3.15
ERBB4Q15303 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
ERBB4Q15303 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
ERBB4Q15303 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
ERBB4Q15303 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
ERBB4Q15303 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
ERBB4Q15303 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
ERBB4Q15303 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
ERBB4Q15303 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
ERBB4Q15303 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
ERBB4Q15303 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
ERBB4Q15303 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
ERBB4Q15303 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
ERBB4Q15303 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
ERBB4Q15303 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
ERBB4Q15303 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
ERBB4Q15303 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
ERBB4Q15303 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
ERBB4Q15303 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
ERBB4Q15303 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
ERBB4Q15303 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
ERBB4Q15303 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
ERBB4Q15303 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
ERBB4Q15303 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
ERBB4Q15303 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
ERBB4Q15303 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
ERBB4Q15303 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
ERBB4Q15303 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
ERBB4Q15303 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
ERBB4Q15303 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
ERBB4Q15303 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
ERBB4Q15303 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC34.51■■■■□ 3.11
ERBB4Q15303 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
ERBB4Q15303 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
ERBB4Q15303 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
ERBB4Q15303 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
ERBB4Q15303 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
ERBB4Q15303 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
ERBB4Q15303 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
ERBB4Q15303 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
ERBB4Q15303 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
ERBB4Q15303 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
ERBB4Q15303 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
ERBB4Q15303 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
ERBB4Q15303 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
ERBB4Q15303 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
ERBB4Q15303 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
ERBB4Q15303 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
ERBB4Q15303 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
ERBB4Q15303 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
ERBB4Q15303 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
ERBB4Q15303 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
ERBB4Q15303 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
ERBB4Q15303 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
ERBB4Q15303 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
ERBB4Q15303 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
ERBB4Q15303 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
ERBB4Q15303 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
ERBB4Q15303 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
ERBB4Q15303 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
ERBB4Q15303 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC34.36■■■■□ 3.09
ERBB4Q15303 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
ERBB4Q15303 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
ERBB4Q15303 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC34.35■■■■□ 3.09
ERBB4Q15303 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms