Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.11■■■■■ 4.81
EEA1Q15075 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC45.11■■■■■ 4.81
EEA1Q15075 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC45.1■■■■■ 4.81
EEA1Q15075 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.09■■■■■ 4.81
EEA1Q15075 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.09■■■■■ 4.81
EEA1Q15075 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC45.08■■■■■ 4.81
EEA1Q15075 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC45.07■■■■■ 4.81
EEA1Q15075 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC45.07■■■■■ 4.81
EEA1Q15075 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC45.06■■■■■ 4.8
EEA1Q15075 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC45.05■■■■■ 4.8
EEA1Q15075 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC45.04■■■■■ 4.8
EEA1Q15075 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.04■■■■■ 4.8
EEA1Q15075 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC45.04■■■■■ 4.8
EEA1Q15075 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC45.02■■■■■ 4.8
EEA1Q15075 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC45.02■■■■■ 4.8
EEA1Q15075 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC45.01■■■■■ 4.8
EEA1Q15075 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC44.99■■■■■ 4.79
EEA1Q15075 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC44.97■■■■■ 4.79
EEA1Q15075 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC44.96■■■■■ 4.79
EEA1Q15075 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC44.96■■■■■ 4.79
EEA1Q15075 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.94■■■■■ 4.79
EEA1Q15075 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.94■■■■■ 4.79
EEA1Q15075 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC44.94■■■■■ 4.79
EEA1Q15075 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC44.94■■■■■ 4.78
EEA1Q15075 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC44.92■■■■■ 4.78
EEA1Q15075 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC44.9■■■■■ 4.78
EEA1Q15075 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.9■■■■■ 4.78
EEA1Q15075 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC44.88■■■■■ 4.78
EEA1Q15075 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.87■■■■■ 4.77
EEA1Q15075 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC44.87■■■■■ 4.77
EEA1Q15075 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC44.85■■■■■ 4.77
EEA1Q15075 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.84■■■■■ 4.77
EEA1Q15075 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC44.84■■■■■ 4.77
EEA1Q15075 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.83■■■■■ 4.77
EEA1Q15075 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC44.82■■■■■ 4.77
EEA1Q15075 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.82■■■■■ 4.77
EEA1Q15075 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.82■■■■■ 4.76
EEA1Q15075 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.8■■■■■ 4.76
EEA1Q15075 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC44.79■■■■■ 4.76
EEA1Q15075 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC44.79■■■■■ 4.76
EEA1Q15075 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC44.78■■■■■ 4.76
EEA1Q15075 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.77■■■■■ 4.76
EEA1Q15075 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.76■■■■■ 4.76
EEA1Q15075 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.75■■■■■ 4.76
EEA1Q15075 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC44.74■■■■■ 4.75
EEA1Q15075 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.71■■■■■ 4.75
EEA1Q15075 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC44.69■■■■■ 4.74
EEA1Q15075 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.68■■■■■ 4.74
EEA1Q15075 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.67■■■■■ 4.74
EEA1Q15075 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.66■■■■■ 4.74
EEA1Q15075 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.66■■■■■ 4.74
EEA1Q15075 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC44.66■■■■■ 4.74
EEA1Q15075 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC44.66■■■■■ 4.74
EEA1Q15075 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.65■■■■■ 4.74
EEA1Q15075 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC44.65■■■■■ 4.74
EEA1Q15075 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.64■■■■■ 4.74
EEA1Q15075 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.64■■■■■ 4.74
EEA1Q15075 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC44.63■■■■■ 4.74
EEA1Q15075 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC44.63■■■■■ 4.73
EEA1Q15075 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.61■■■■■ 4.73
EEA1Q15075 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC44.61■■■■■ 4.73
EEA1Q15075 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC44.6■■■■■ 4.73
EEA1Q15075 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.59■■■■■ 4.73
EEA1Q15075 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC44.58■■■■■ 4.73
EEA1Q15075 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC44.58■■■■■ 4.73
EEA1Q15075 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.57■■■■■ 4.73
EEA1Q15075 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC44.56■■■■■ 4.72
EEA1Q15075 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.53■■■■■ 4.72
EEA1Q15075 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.49■■■■■ 4.71
EEA1Q15075 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC44.49■■■■■ 4.71
EEA1Q15075 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.49■■■■■ 4.71
EEA1Q15075 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC44.49■■■■■ 4.71
EEA1Q15075 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC44.49■■■■■ 4.71
EEA1Q15075 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.48■■■■■ 4.71
EEA1Q15075 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.48■■■■■ 4.71
EEA1Q15075 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC44.48■■■■■ 4.71
EEA1Q15075 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
EEA1Q15075 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
EEA1Q15075 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC44.46■■■■■ 4.71
EEA1Q15075 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC44.43■■■■■ 4.7
EEA1Q15075 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC44.42■■■■■ 4.7
EEA1Q15075 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC44.42■■■■■ 4.7
EEA1Q15075 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.42■■■■■ 4.7
EEA1Q15075 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC44.41■■■■■ 4.7
EEA1Q15075 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.41■■■■■ 4.7
EEA1Q15075 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.41■■■■■ 4.7
EEA1Q15075 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC44.4■■■■■ 4.7
EEA1Q15075 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.4■■■■■ 4.7
EEA1Q15075 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC44.37■■■■■ 4.69
EEA1Q15075 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.34■■■■■ 4.69
EEA1Q15075 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC44.34■■■■■ 4.69
EEA1Q15075 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC44.34■■■■■ 4.69
EEA1Q15075 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.33■■■■■ 4.69
EEA1Q15075 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC44.33■■■■■ 4.69
EEA1Q15075 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.68
EEA1Q15075 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC44.3■■■■■ 4.68
EEA1Q15075 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC44.3■■■■■ 4.68
EEA1Q15075 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.28■■■■■ 4.68
EEA1Q15075 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.28■■■■■ 4.68
EEA1Q15075 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.28■■■■■ 4.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms