Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
CNGB1Q14028 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
CNGB1Q14028 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
CNGB1Q14028 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
CNGB1Q14028 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
CNGB1Q14028 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
CNGB1Q14028 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
CNGB1Q14028 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
CNGB1Q14028 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
CNGB1Q14028 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC37.27■■■■□ 3.56
CNGB1Q14028 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
CNGB1Q14028 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
CNGB1Q14028 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
CNGB1Q14028 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
CNGB1Q14028 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
CNGB1Q14028 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC37.22■■■■□ 3.55
CNGB1Q14028 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
CNGB1Q14028 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
CNGB1Q14028 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
CNGB1Q14028 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
CNGB1Q14028 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
CNGB1Q14028 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
CNGB1Q14028 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
CNGB1Q14028 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.54
CNGB1Q14028 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
CNGB1Q14028 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
CNGB1Q14028 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
CNGB1Q14028 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
CNGB1Q14028 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
CNGB1Q14028 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
CNGB1Q14028 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
CNGB1Q14028 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
CNGB1Q14028 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.06■■■■□ 3.52
CNGB1Q14028 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
CNGB1Q14028 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
CNGB1Q14028 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
CNGB1Q14028 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
CNGB1Q14028 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
CNGB1Q14028 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
CNGB1Q14028 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
CNGB1Q14028 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC37■■■■□ 3.51
CNGB1Q14028 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
CNGB1Q14028 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
CNGB1Q14028 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
CNGB1Q14028 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
CNGB1Q14028 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
CNGB1Q14028 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
CNGB1Q14028 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
CNGB1Q14028 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
CNGB1Q14028 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
CNGB1Q14028 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
CNGB1Q14028 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
CNGB1Q14028 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
CNGB1Q14028 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
CNGB1Q14028 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
CNGB1Q14028 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
CNGB1Q14028 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
CNGB1Q14028 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
CNGB1Q14028 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
CNGB1Q14028 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
CNGB1Q14028 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC36.9■■■■□ 3.5
CNGB1Q14028 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
CNGB1Q14028 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
CNGB1Q14028 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
CNGB1Q14028 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC36.89■■■■□ 3.5
CNGB1Q14028 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
CNGB1Q14028 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
CNGB1Q14028 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
CNGB1Q14028 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
CNGB1Q14028 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
CNGB1Q14028 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
CNGB1Q14028 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
CNGB1Q14028 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
CNGB1Q14028 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
CNGB1Q14028 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
CNGB1Q14028 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
CNGB1Q14028 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
CNGB1Q14028 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
CNGB1Q14028 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
CNGB1Q14028 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CNGB1Q14028 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
CNGB1Q14028 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
CNGB1Q14028 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
CNGB1Q14028 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
CNGB1Q14028 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
CNGB1Q14028 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
CNGB1Q14028 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
CNGB1Q14028 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
CNGB1Q14028 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC36.66■■■■□ 3.46
CNGB1Q14028 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
CNGB1Q14028 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
CNGB1Q14028 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
CNGB1Q14028 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
CNGB1Q14028 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
CNGB1Q14028 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
CNGB1Q14028 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
CNGB1Q14028 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
CNGB1Q14028 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC36.61■■■■□ 3.45
CNGB1Q14028 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
CNGB1Q14028 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
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