Protein–RNA interactions for Protein: Q14003

KCNC3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

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Length 757 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3Q14003 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
KCNC3Q14003 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
KCNC3Q14003 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
KCNC3Q14003 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
KCNC3Q14003 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
KCNC3Q14003 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
KCNC3Q14003 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
KCNC3Q14003 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
KCNC3Q14003 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KCNC3Q14003 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
KCNC3Q14003 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KCNC3Q14003 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
KCNC3Q14003 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
KCNC3Q14003 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
KCNC3Q14003 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
KCNC3Q14003 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
KCNC3Q14003 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
KCNC3Q14003 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KCNC3Q14003 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
KCNC3Q14003 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
KCNC3Q14003 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
KCNC3Q14003 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
KCNC3Q14003 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
KCNC3Q14003 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
KCNC3Q14003 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KCNC3Q14003 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
KCNC3Q14003 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
KCNC3Q14003 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
KCNC3Q14003 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
KCNC3Q14003 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
KCNC3Q14003 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
KCNC3Q14003 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KCNC3Q14003 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
KCNC3Q14003 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KCNC3Q14003 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KCNC3Q14003 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
KCNC3Q14003 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
KCNC3Q14003 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KCNC3Q14003 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KCNC3Q14003 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KCNC3Q14003 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KCNC3Q14003 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KCNC3Q14003 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KCNC3Q14003 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KCNC3Q14003 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
KCNC3Q14003 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
KCNC3Q14003 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
KCNC3Q14003 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
KCNC3Q14003 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
KCNC3Q14003 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
KCNC3Q14003 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KCNC3Q14003 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
KCNC3Q14003 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
KCNC3Q14003 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KCNC3Q14003 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KCNC3Q14003 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KCNC3Q14003 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KCNC3Q14003 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
KCNC3Q14003 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
KCNC3Q14003 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KCNC3Q14003 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KCNC3Q14003 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
KCNC3Q14003 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KCNC3Q14003 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KCNC3Q14003 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KCNC3Q14003 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
KCNC3Q14003 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KCNC3Q14003 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KCNC3Q14003 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KCNC3Q14003 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
KCNC3Q14003 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
KCNC3Q14003 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
KCNC3Q14003 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
KCNC3Q14003 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
KCNC3Q14003 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
KCNC3Q14003 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
KCNC3Q14003 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
KCNC3Q14003 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
KCNC3Q14003 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
KCNC3Q14003 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KCNC3Q14003 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
KCNC3Q14003 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KCNC3Q14003 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KCNC3Q14003 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
KCNC3Q14003 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
KCNC3Q14003 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
KCNC3Q14003 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KCNC3Q14003 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KCNC3Q14003 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KCNC3Q14003 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KCNC3Q14003 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
KCNC3Q14003 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KCNC3Q14003 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KCNC3Q14003 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
KCNC3Q14003 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KCNC3Q14003 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KCNC3Q14003 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KCNC3Q14003 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KCNC3Q14003 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KCNC3Q14003 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
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