Protein–RNA interactions for Protein: Q13442

PDAP1, 28 kDa heat- and acid-stable phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDAP1Q13442 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDAP1Q13442 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDAP1Q13442 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDAP1Q13442 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDAP1Q13442 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDAP1Q13442 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDAP1Q13442 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDAP1Q13442 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDAP1Q13442 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDAP1Q13442 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDAP1Q13442 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDAP1Q13442 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDAP1Q13442 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDAP1Q13442 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDAP1Q13442 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDAP1Q13442 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDAP1Q13442 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDAP1Q13442 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDAP1Q13442 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDAP1Q13442 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDAP1Q13442 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDAP1Q13442 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDAP1Q13442 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDAP1Q13442 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDAP1Q13442 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDAP1Q13442 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDAP1Q13442 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDAP1Q13442 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDAP1Q13442 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDAP1Q13442 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDAP1Q13442 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDAP1Q13442 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDAP1Q13442 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDAP1Q13442 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDAP1Q13442 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDAP1Q13442 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDAP1Q13442 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDAP1Q13442 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDAP1Q13442 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDAP1Q13442 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDAP1Q13442 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDAP1Q13442 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PDAP1Q13442 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDAP1Q13442 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PDAP1Q13442 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PDAP1Q13442 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDAP1Q13442 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDAP1Q13442 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDAP1Q13442 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDAP1Q13442 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDAP1Q13442 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDAP1Q13442 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PDAP1Q13442 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDAP1Q13442 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDAP1Q13442 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDAP1Q13442 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDAP1Q13442 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PDAP1Q13442 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDAP1Q13442 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDAP1Q13442 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
PDAP1Q13442 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDAP1Q13442 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDAP1Q13442 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDAP1Q13442 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDAP1Q13442 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDAP1Q13442 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDAP1Q13442 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDAP1Q13442 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDAP1Q13442 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDAP1Q13442 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PDAP1Q13442 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDAP1Q13442 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PDAP1Q13442 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PDAP1Q13442 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PDAP1Q13442 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PDAP1Q13442 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDAP1Q13442 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDAP1Q13442 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDAP1Q13442 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDAP1Q13442 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDAP1Q13442 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDAP1Q13442 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDAP1Q13442 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDAP1Q13442 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDAP1Q13442 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDAP1Q13442 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDAP1Q13442 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDAP1Q13442 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PDAP1Q13442 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDAP1Q13442 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDAP1Q13442 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDAP1Q13442 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PDAP1Q13442 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDAP1Q13442 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDAP1Q13442 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDAP1Q13442 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDAP1Q13442 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDAP1Q13442 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDAP1Q13442 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDAP1Q13442 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms