Protein–RNA interactions for Protein: Q13283

G3BP1, Ras GTPase-activating protein-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
G3BP1Q13283 ALDH1A1-202ENST00000376939 822 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.971e-7■■■■■ 28
G3BP1Q13283 RPS6KA3-202ENST00000438357 530 ntTSL 518.37■□□□□ 0.534e-9■■■■■ 27.9
G3BP1Q13283 RPS6KA3-206ENST00000492128 553 ntTSL 411.13□□□□□ -0.634e-9■■■■■ 27.9
G3BP1Q13283 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.797e-7■■■■■ 27.8
G3BP1Q13283 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.617e-7■■■■■ 27.8
G3BP1Q13283 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.57e-7■■■■■ 27.8
G3BP1Q13283 PES1-205ENST00000405677 2708 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.097e-7■■■■■ 27.8
G3BP1Q13283 PES1-203ENST00000402281 2760 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.157e-7■■■■■ 27.8
G3BP1Q13283 WDR1-217ENST00000515018 274 ntTSL 39.36□□□□□ -0.915e-10■■■■■ 27.7
G3BP1Q13283 HADHA-202ENST00000461025 431 ntTSL 313.84□□□□□ -0.194e-8■■■■■ 27.7
G3BP1Q13283 C20orf24-205ENST00000491113 734 ntTSL 232.27■■■□□ 2.765e-8■■■■■ 27.6
G3BP1Q13283 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.415e-8■■■■■ 27.6
G3BP1Q13283 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.415e-8■■■■■ 27.6
G3BP1Q13283 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.45e-8■■■■■ 27.6
G3BP1Q13283 C20orf24-206ENST00000492721 1044 ntTSL 226.74■■□□□ 1.875e-8■■■■■ 27.6
G3BP1Q13283 C20orf24-204ENST00000483815 1170 ntTSL 1 (best)22.28■■□□□ 1.165e-8■■■■■ 27.6
G3BP1Q13283 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.765e-8■■■■■ 27.6
G3BP1Q13283 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.75e-8■■■■■ 27.6
G3BP1Q13283 DDC-210ENST00000494914 891 ntTSL 214.58□□□□□ -0.085e-8■■■■■ 27.6
G3BP1Q13283 C20orf24-207ENST00000494506 874 ntTSL 29.72□□□□□ -0.855e-8■■■■■ 27.6
G3BP1Q13283 TRIP12-216ENST00000487178 977 ntTSL 27.18□□□□□ -1.265e-8■■■■■ 27.6
G3BP1Q13283 IQGAP2-212ENST00000509741 394 ntTSL 26.36□□□□□ -1.395e-8■■■■■ 27.6
G3BP1Q13283 NUP205-206ENST00000477620 1800 ntTSL 55.56□□□□□ -1.525e-8■■■■■ 27.6
G3BP1Q13283 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.815e-8■■■■■ 27.6
G3BP1Q13283 PDCD4-202ENST00000393104 3697 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.295e-8■■■■■ 27.5
G3BP1Q13283 PDCD4-201ENST00000280154 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.685e-8■■■■■ 27.5
G3BP1Q13283 PDCD4-207ENST00000483595 531 ntTSL 58.05□□□□□ -1.125e-8■■■■■ 27.5
G3BP1Q13283 PDCD4-204ENST00000462577 789 ntTSL 56.39□□□□□ -1.395e-8■■■■■ 27.5
G3BP1Q13283 EIF4A3-208ENST00000576573 697 ntTSL 29.65□□□□□ -0.869e-7■■■■■ 27.4
G3BP1Q13283 PUF60-214ENST00000529693 684 ntTSL 221.64■■□□□ 1.051e-6■■■■■ 27.4
G3BP1Q13283 PUF60-213ENST00000528999 431 ntTSL 313.02□□□□□ -0.331e-6■■■■■ 27.4
G3BP1Q13283 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.131e-7■■■■■ 27.4
G3BP1Q13283 RRN3-201ENST00000198767 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.721e-7■■■■■ 27.4
G3BP1Q13283 RRN3-203ENST00000429751 2198 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.91e-7■■■■■ 27.4
G3BP1Q13283 RRN3-202ENST00000327307 2039 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.161e-7■■■■■ 27.4
G3BP1Q13283 RRN3-204ENST00000561685 615 ntTSL 52.72□□□□□ -1.971e-7■■■■■ 27.4
G3BP1Q13283 VARS-216ENST00000428445 863 ntTSL 520.41■□□□□ 0.868e-7■■■■■ 27.3
G3BP1Q13283 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.651e-7■■■■■ 27.3
G3BP1Q13283 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.081e-7■■■■■ 27.3
G3BP1Q13283 CAPNS1-212ENST00000591041 812 ntTSL 327.92■■■□□ 2.061e-7■■■■■ 27.3
G3BP1Q13283 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.861e-7■■■■■ 27.3
G3BP1Q13283 NUP205-210ENST00000607647 4518 ntTSL 56.9□□□□□ -1.32e-7■■■■■ 27.3
G3BP1Q13283 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.522e-7■■■■■ 27.3
G3BP1Q13283 PPME1-204ENST00000538501 744 ntTSL 1 (best)8.85□□□□□ -0.991e-6■■■■■ 27.3
G3BP1Q13283 PPME1-206ENST00000541340 3618 ntTSL 1 (best)8.4□□□□□ -1.061e-6■■■■■ 27.3
G3BP1Q13283 VPS35-211ENST00000569950 1096 ntTSL 511.5□□□□□ -0.571e-8■■■■■ 27.2
G3BP1Q13283 SPTAN1-207ENST00000476825 635 ntTSL 311.27□□□□□ -0.612e-7■■■■■ 27.2
G3BP1Q13283 PDCD4-205ENST00000467574 735 ntTSL 332.18■■■□□ 2.744e-14■■■■■ 27.2
G3BP1Q13283 PDCD4-203ENST00000444997 819 ntTSL 321.54■■□□□ 1.044e-14■■■■■ 27.2
G3BP1Q13283 PDCD4-210ENST00000492932 813 ntTSL 314.35□□□□□ -0.114e-14■■■■■ 27.2
G3BP1Q13283 PDCD4-206ENST00000481353 1120 ntTSL 29.46□□□□□ -0.94e-14■■■■■ 27.2
G3BP1Q13283 PDCD4-209ENST00000489049 547 ntTSL 28.05□□□□□ -1.124e-14■■■■■ 27.2
G3BP1Q13283 PHB-208ENST00000507748 582 ntTSL 1 (best)6.19□□□□□ -1.423e-10■■■■■ 27.2
G3BP1Q13283 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.043e-12■■■■■ 27.1
G3BP1Q13283 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.53e-12■■■■■ 27.1
G3BP1Q13283 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.453e-12■■■■■ 27.1
G3BP1Q13283 PSME1-210ENST00000561435 945 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.23e-12■■■■■ 27.1
G3BP1Q13283 PSME1-206ENST00000559741 763 ntTSL 312.41□□□□□ -0.423e-12■■■■■ 27.1
G3BP1Q13283 CCT8-202ENST00000431234 968 ntTSL 55.14□□□□□ -1.592e-7■■■■■ 27.1
G3BP1Q13283 LDHA-215ENST00000537296 1511 ntTSL 213.42□□□□□ -0.268e-16■■■■■ 27.1
G3BP1Q13283 TLN1-207ENST00000489255 798 ntTSL 216.21■□□□□ 0.196e-8■■■■■ 27
G3BP1Q13283 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.33e-7■■■■■ 27
G3BP1Q13283 ZSWIM8-204ENST00000431225 1687 ntTSL 522.11■■□□□ 1.133e-7■■■■■ 27
G3BP1Q13283 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.93e-7■■■■■ 27
G3BP1Q13283 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.863e-7■■■■■ 27
G3BP1Q13283 ZSWIM8-205ENST00000433366 5773 ntTSL 520.28■□□□□ 0.843e-7■■■■■ 27
G3BP1Q13283 POLR3A-203ENST00000473588 1022 ntTSL 519.43■□□□□ 0.73e-7■■■■■ 27
G3BP1Q13283 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.63e-7■■■■■ 27
G3BP1Q13283 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.573e-7■■■■■ 27
G3BP1Q13283 RNF213-218ENST00000574060 540 ntTSL 216.58■□□□□ 0.243e-7■■■■■ 27
G3BP1Q13283 PRRC2B-209ENST00000489593 797 ntTSL 216.5■□□□□ 0.233e-7■■■■■ 27
G3BP1Q13283 RNF181-205ENST00000456023 559 ntTSL 316.03■□□□□ 0.163e-20■■■■■ 27
G3BP1Q13283 RNF181-203ENST00000441634 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.163e-20■■■■■ 27
G3BP1Q13283 RNF181-201ENST00000306368 569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.163e-20■■■■■ 27
G3BP1Q13283 POLR3A-202ENST00000472014 699 ntTSL 315.51■□□□□ 0.073e-7■■■■■ 27
G3BP1Q13283 RNF181-206ENST00000461845 623 ntTSL 215.05■□□□□ -03e-20■■■■■ 27
G3BP1Q13283 ZSWIM8-212ENST00000492395 4490 ntTSL 1 (best)15.03■□□□□ -03e-7■■■■■ 27
G3BP1Q13283 RNF181-204ENST00000443647 535 ntTSL 213.56□□□□□ -0.243e-20■■■■■ 27
G3BP1Q13283 RNF181-202ENST00000414390 327 ntTSL 213.46□□□□□ -0.253e-20■■■■■ 27
G3BP1Q13283 ALDH1A1-201ENST00000297785 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.92e-7■■■■■ 26.9
G3BP1Q13283 LDHA-202ENST00000375710 2169 ntTSL 28.22□□□□□ -1.097e-16■■■■■ 26.9
G3BP1Q13283 TGM2-205ENST00000469269 3467 ntTSL 213□□□□□ -0.331e-6■■■■■ 26.9
G3BP1Q13283 MCM4-216ENST00000524086 547 ntTSL 515.59■□□□□ 0.097e-8■■■■■ 26.8
G3BP1Q13283 MCM4-207ENST00000519170 734 ntTSL 314.33□□□□□ -0.127e-8■■■■■ 26.8
G3BP1Q13283 MCM4-203ENST00000518221 572 ntTSL 413.73□□□□□ -0.217e-8■■■■■ 26.8
G3BP1Q13283 MYL12A-205ENST00000578562 623 ntTSL 31.93□□□□□ -2.12e-7■■■■■ 26.8
G3BP1Q13283 MCM2-204ENST00000472731 547 ntTSL 217.6■□□□□ 0.414e-7■■■■□ 26.7
G3BP1Q13283 ILF2-203ENST00000368684 476 ntTSL 58.13□□□□□ -1.112e-6■■■■□ 26.7
G3BP1Q13283 LDHA-210ENST00000486690 664 ntTSL 59□□□□□ -0.978e-16■■■■□ 26.7
G3BP1Q13283 MCM2-203ENST00000468659 557 ntTSL 426.22■■□□□ 1.792e-7■■■■□ 26.7
G3BP1Q13283 DIAPH1-208ENST00000476339 2606 ntTSL 213.97□□□□□ -0.171e-6■■■■□ 26.7
G3BP1Q13283 FAM98A-206ENST00000475122 1032 ntTSL 1 (best)27.25■■□□□ 1.951e-7■■■■□ 26.6
G3BP1Q13283 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.851e-7■■■■□ 26.6
G3BP1Q13283 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.841e-7■■■■□ 26.6
G3BP1Q13283 UBOX5-203ENST00000449731 524 ntTSL 519.95■□□□□ 0.781e-7■■■■□ 26.6
G3BP1Q13283 AIFM1-204ENST00000416073 2248 ntTSL 1 (best)18.81■□□□□ 0.61e-7■■■■□ 26.6
G3BP1Q13283 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.581e-7■■■■□ 26.6
G3BP1Q13283 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.541e-7■■■■□ 26.6
G3BP1Q13283 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.541e-7■■■■□ 26.6
G3BP1Q13283 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.481e-7■■■■□ 26.6
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