RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591041.5

CAPNS1-212, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-212ENST00000591041 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.18■■■■■ 5.78
CAPNS1-212ENST00000591041 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa44.86■■■■■ 4.77
CAPNS1-212ENST00000591041 ABCC9O60706 1549 aa43.59■■■■■ 4.57
CAPNS1-212ENST00000591041 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP42.95■■■■■ 4.47
CAPNS1-212ENST00000591041 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.5■■■■■ 4.39
CAPNS1-212ENST00000591041 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.26■■■■■ 4.36
CAPNS1-212ENST00000591041 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.1■■■■■ 4.33
CAPNS1-212ENST00000591041 NACADO15069 1562 aa41.83■■■■■ 4.29
CAPNS1-212ENST00000591041 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.5■■■■■ 4.23
CAPNS1-212ENST00000591041 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa41.41■■■■■ 4.22
CAPNS1-212ENST00000591041 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.3■■■■■ 4.2
CAPNS1-212ENST00000591041 SCRIBQ14160 1630 aa40.99■■■■■ 4.15
CAPNS1-212ENST00000591041 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP40.53■■■■■ 4.08
CAPNS1-212ENST00000591041 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.31■■■■■ 4.04
CAPNS1-212ENST00000591041 BICRAQ9NZM4 1560 aa39.97■■■■□ 3.99
CAPNS1-212ENST00000591041 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.92■■■■□ 3.98
CAPNS1-212ENST00000591041 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP39.66■■■■□ 3.94
CAPNS1-212ENST00000591041 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP39.57■■■■□ 3.93
CAPNS1-212ENST00000591041 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.56■■■■□ 3.92
CAPNS1-212ENST00000591041 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.39■■■■□ 3.9
CAPNS1-212ENST00000591041 SMARCA4P51532 1647 aa39.36■■■■□ 3.89
CAPNS1-212ENST00000591041 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.31■■■■□ 3.88
CAPNS1-212ENST00000591041 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.08■■■■□ 3.85
CAPNS1-212ENST00000591041 WIZO95785 1651 aa39.05■■■■□ 3.84
CAPNS1-212ENST00000591041 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.95■■■■□ 3.83
CAPNS1-212ENST00000591041 SMARCA2P51531 1590 aa38.91■■■■□ 3.82
CAPNS1-212ENST00000591041 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP38.85■■■■□ 3.81
CAPNS1-212ENST00000591041 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.73■■■■□ 3.79
CAPNS1-212ENST00000591041 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.61■■■■□ 3.77
CAPNS1-212ENST00000591041 NCAPD3P42695 1498 aa38.51■■■■□ 3.76
CAPNS1-212ENST00000591041 HMGXB3Q12766 1538 aa38.49■■■■□ 3.75
CAPNS1-212ENST00000591041 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.35■■■■□ 3.73
CAPNS1-212ENST00000591041 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.33■■■■□ 3.73
CAPNS1-212ENST00000591041 CHIC1Q5VXU3 224 aa38.14■■■■□ 3.7
CAPNS1-212ENST00000591041 CUX2O14529 1486 aa37.75■■■■□ 3.63
CAPNS1-212ENST00000591041 ERCC6Q03468 1493 aa37.74■■■■□ 3.63
CAPNS1-212ENST00000591041 TRIM41Q8WV44 630 aa37.73■■■■□ 3.63
CAPNS1-212ENST00000591041 CFTRP13569 1480 aa37.58■■■■□ 3.61
CAPNS1-212ENST00000591041 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.51■■■■□ 3.59
CAPNS1-212ENST00000591041 PRDM2Q13029 1718 aa37.45■■■■□ 3.59
CAPNS1-212ENST00000591041 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.38■■■■□ 3.57
CAPNS1-212ENST00000591041 ABCC8Q09428 1581 aa37.36■■■■□ 3.57
CAPNS1-212ENST00000591041 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.29■■■■□ 3.56
CAPNS1-212ENST00000591041 NESP48681 1621 aa37.26■■■■□ 3.56
CAPNS1-212ENST00000591041 TOP2BQ02880 1626 aa37.07■■■■□ 3.53
CAPNS1-212ENST00000591041 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.07■■■■□ 3.52
CAPNS1-212ENST00000591041 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.07■■■■□ 3.52
CAPNS1-212ENST00000591041 SYNJ1O43426 1573 aa37.05■■■■□ 3.52
CAPNS1-212ENST00000591041 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.04■■■■□ 3.52
CAPNS1-212ENST00000591041 EEA1Q15075 1411 aa37.02■■■■□ 3.52
CAPNS1-212ENST00000591041 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.95■■■■□ 3.51
CAPNS1-212ENST00000591041 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.93■■■■□ 3.5
CAPNS1-212ENST00000591041 CUX1P39880 1505 aa36.88■■■■□ 3.49
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP36.8■■■■□ 3.48
CAPNS1-212ENST00000591041 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.76■■■■□ 3.48
CAPNS1-212ENST00000591041 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.76■■■■□ 3.47
CAPNS1-212ENST00000591041 SOGA1O94964 1423 aa36.66■■■■□ 3.46
CAPNS1-212ENST00000591041 CSRNP3Q8WYN3 585 aa36.62■■■■□ 3.45
CAPNS1-212ENST00000591041 TOPBP1Q92547 1522 aa36.61■■■■□ 3.45
CAPNS1-212ENST00000591041 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.56■■■■□ 3.44
CAPNS1-212ENST00000591041 KIF27Q86VH2 1401 aa36.56■■■■□ 3.44
CAPNS1-212ENST00000591041 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa36.52■■■■□ 3.44
CAPNS1-212ENST00000591041 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.5■■■■□ 3.43
CAPNS1-212ENST00000591041 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.48■■■■□ 3.43
CAPNS1-212ENST00000591041 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa36.41■■■■□ 3.42
CAPNS1-212ENST00000591041 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.39■■■■□ 3.42
CAPNS1-212ENST00000591041 GOLGA3Q08378 1498 aa36.35■■■■□ 3.41
CAPNS1-212ENST00000591041 KIF21BO75037 1637 aa36.34■■■■□ 3.41
CAPNS1-212ENST00000591041 WDR62O43379 1518 aa36.34■■■■□ 3.41
CAPNS1-212ENST00000591041 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.32■■■■□ 3.4
CAPNS1-212ENST00000591041 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.18■■■■□ 3.38
CAPNS1-212ENST00000591041 TNIKQ9UKE5 1360 aa36.17■■■■□ 3.38
CAPNS1-212ENST00000591041 UBTFP17480 764 aaKnown RBP36.17■■■■□ 3.38
CAPNS1-212ENST00000591041 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.17■■■■□ 3.38
CAPNS1-212ENST00000591041 EHMT2Q96KQ7 1210 aa36.14■■■■□ 3.38
CAPNS1-212ENST00000591041 PRXQ9BXM0 1461 aa36.11■■■■□ 3.37
CAPNS1-212ENST00000591041 WDR97A6NE52 1622 aa36.11■■■■□ 3.37
CAPNS1-212ENST00000591041 IFT140Q96RY7 1462 aa36.09■■■■□ 3.37
CAPNS1-212ENST00000591041 IGF1RP08069 1367 aa36.05■■■■□ 3.36
CAPNS1-212ENST00000591041 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.02■■■■□ 3.36
CAPNS1-212ENST00000591041 OSCARQ8IYS5 282 aa36.01■■■■□ 3.36
CAPNS1-212ENST00000591041 CUL7Q14999 1698 aa35.99■■■■□ 3.35
CAPNS1-212ENST00000591041 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.98■■■■□ 3.35
CAPNS1-212ENST00000591041 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa35.98■■■■□ 3.35
CAPNS1-212ENST00000591041 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa35.97■■■■□ 3.35
CAPNS1-212ENST00000591041 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.97■■■■□ 3.35
CAPNS1-212ENST00000591041 CEP162Q5TB80 1403 aa35.89■■■■□ 3.34
CAPNS1-212ENST00000591041 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.89■■■■□ 3.34
CAPNS1-212ENST00000591041 GRIN2BQ13224 1484 aa35.78■■■■□ 3.32
CAPNS1-212ENST00000591041 PBRM1Q86U86 1689 aa35.73■■■■□ 3.31
CAPNS1-212ENST00000591041 CLIP1P30622 1438 aa35.7■■■■□ 3.31
CAPNS1-212ENST00000591041 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.65■■■■□ 3.38e-9■□□□□ 10.5
CAPNS1-212ENST00000591041 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.65■■■■□ 3.3
CAPNS1-212ENST00000591041 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.59■■■■□ 3.29
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.58■■■■□ 3.29
CAPNS1-212ENST00000591041 ADAMTS12P58397 1594 aa35.54■■■■□ 3.28
CAPNS1-212ENST00000591041 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.54■■■■□ 3.28
CAPNS1-212ENST00000591041 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.54■■■■□ 3.28
CAPNS1-212ENST00000591041 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.54■■■■□ 3.28
CAPNS1-212ENST00000591041 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.52■■■■□ 3.28
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