RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000287295.7

AIFM1-201, Transcript of apoptosis inducing factor mitochondria associated 1, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene AIFM1, Length 2,260 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AIFM1-201ENST00000287295 NISCHQ9Y2I1 1504 aa36.62■■■■□ 3.45
AIFM1-201ENST00000287295 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa31.56■■■□□ 2.64
AIFM1-201ENST00000287295 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP30.82■■■□□ 2.52
AIFM1-201ENST00000287295 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.45■■■□□ 2.46
AIFM1-201ENST00000287295 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.4■■■□□ 2.46
AIFM1-201ENST00000287295 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa30.13■■■□□ 2.41
AIFM1-201ENST00000287295 ABCC9O60706 1549 aa29.8■■■□□ 2.36
AIFM1-201ENST00000287295 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.59■■■□□ 2.33
AIFM1-201ENST00000287295 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.48■■■□□ 2.31
AIFM1-201ENST00000287295 NACADO15069 1562 aa29.36■■■□□ 2.29
AIFM1-201ENST00000287295 SCRIBQ14160 1630 aa29.32■■■□□ 2.28
AIFM1-201ENST00000287295 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.03■■■□□ 2.24
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AIFM1-201ENST00000287295 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.57■■■□□ 2.16
AIFM1-201ENST00000287295 UNC13AQ9UPW8 1703 aa28.56■■■□□ 2.16
AIFM1-201ENST00000287295 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.4■■■□□ 2.14
AIFM1-201ENST00000287295 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.36■■■□□ 2.13
AIFM1-201ENST00000287295 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP28.3■■■□□ 2.12
AIFM1-201ENST00000287295 BICRAQ9NZM4 1560 aa28.27■■■□□ 2.12
AIFM1-201ENST00000287295 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
AIFM1-201ENST00000287295 WIZO95785 1651 aa28.19■■■□□ 2.1
AIFM1-201ENST00000287295 SMARCA4P51532 1647 aa28.04■■■□□ 2.08
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AIFM1-201ENST00000287295 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.61■■■□□ 2.01
AIFM1-201ENST00000287295 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.61■■■□□ 2.01
AIFM1-201ENST00000287295 SMARCA2P51531 1590 aa27.58■■■□□ 2.01
AIFM1-201ENST00000287295 TRIM41Q8WV44 630 aa27.58■■■□□ 2.01
AIFM1-201ENST00000287295 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.53■■■□□ 2
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AIFM1-201ENST00000287295 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa27.43■■□□□ 1.98
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AIFM1-201ENST00000287295 HMGXB3Q12766 1538 aa27.09■■□□□ 1.93
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AIFM1-201ENST00000287295 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.88■■□□□ 1.89
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AIFM1-201ENST00000287295 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.74■■□□□ 1.87
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AIFM1-201ENST00000287295 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26.61■■□□□ 1.85
AIFM1-201ENST00000287295 EEA1Q15075 1411 aa26.6■■□□□ 1.85
AIFM1-201ENST00000287295 TOP2BQ02880 1626 aa26.58■■□□□ 1.85
AIFM1-201ENST00000287295 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.56■■□□□ 1.84
AIFM1-201ENST00000287295 PCGF6Q9BYE7 350 aa26.55■■□□□ 1.84
AIFM1-201ENST00000287295 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.51■■□□□ 1.83
AIFM1-201ENST00000287295 CUX1P39880 1505 aa26.49■■□□□ 1.83
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AIFM1-201ENST00000287295 TNIKQ9UKE5 1360 aa26.36■■□□□ 1.81
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AIFM1-201ENST00000287295 CEP162Q5TB80 1403 aa26.31■■□□□ 1.8
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AIFM1-201ENST00000287295 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.29■■□□□ 1.8
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AIFM1-201ENST00000287295 KIF27Q86VH2 1401 aa26.16■■□□□ 1.78
AIFM1-201ENST00000287295 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.13■■□□□ 1.77
AIFM1-201ENST00000287295 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.12■■□□□ 1.77
AIFM1-201ENST00000287295 PRXQ9BXM0 1461 aa26.11■■□□□ 1.77
AIFM1-201ENST00000287295 CUX2O14529 1486 aa26.06■■□□□ 1.76
AIFM1-201ENST00000287295 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.03■■□□□ 1.76
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AIFM1-201ENST00000287295 HRCP23327 699 aa26.02■■□□□ 1.76
AIFM1-201ENST00000287295 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.01■■□□□ 1.75
AIFM1-201ENST00000287295 CLIP1P30622 1438 aa26■■□□□ 1.75
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AIFM1-201ENST00000287295 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.96■■□□□ 1.75
AIFM1-201ENST00000287295 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.96■■□□□ 1.75
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AIFM1-201ENST00000287295 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
AIFM1-201ENST00000287295 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.88■■□□□ 1.73
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AIFM1-201ENST00000287295 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa25.82■■□□□ 1.72
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AIFM1-201ENST00000287295 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa25.63■■□□□ 1.69
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AIFM1-201ENST00000287295 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.59■■□□□ 1.69
AIFM1-201ENST00000287295 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
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AIFM1-201ENST00000287295 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.44■■□□□ 1.662e-6■■■■■ 34.3
AIFM1-201ENST00000287295 WDR62O43379 1518 aa25.43■■□□□ 1.66
AIFM1-201ENST00000287295 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
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AIFM1-201ENST00000287295 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.65
AIFM1-201ENST00000287295 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa25.36■■□□□ 1.65
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