RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000354694.11

PES1-202, Transcript of pescadillo ribosomal biogenesis factor 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PES1, Length 2,295 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PES1-202ENST00000354694 NISCHQ9Y2I1 1504 aa36.48■■■■□ 3.43
PES1-202ENST00000354694 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa31.67■■■□□ 2.66
PES1-202ENST00000354694 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP30.67■■■□□ 2.5
PES1-202ENST00000354694 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.25■■■□□ 2.43
PES1-202ENST00000354694 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.09■■■□□ 2.41
PES1-202ENST00000354694 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa30.04■■■□□ 2.4
PES1-202ENST00000354694 ABCC9O60706 1549 aa29.94■■■□□ 2.38
PES1-202ENST00000354694 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.59■■■□□ 2.33
PES1-202ENST00000354694 NACADO15069 1562 aa29.44■■■□□ 2.3
PES1-202ENST00000354694 SCRIBQ14160 1630 aa29.31■■■□□ 2.28
PES1-202ENST00000354694 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.17■■■□□ 2.26
PES1-202ENST00000354694 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.24
PES1-202ENST00000354694 UNC13AQ9UPW8 1703 aa28.79■■■□□ 2.2
PES1-202ENST00000354694 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.43■■■□□ 2.14
PES1-202ENST00000354694 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.4■■■□□ 2.14
PES1-202ENST00000354694 BICRAQ9NZM4 1560 aa28.38■■■□□ 2.13
PES1-202ENST00000354694 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP28.31■■■□□ 2.12
PES1-202ENST00000354694 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.26■■■□□ 2.11
PES1-202ENST00000354694 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP28.12■■■□□ 2.09
PES1-202ENST00000354694 WIZO95785 1651 aa28.09■■■□□ 2.09
PES1-202ENST00000354694 SMARCA4P51532 1647 aa28.03■■■□□ 2.08
PES1-202ENST00000354694 CHIC1Q5VXU3 224 aa27.79■■■□□ 2.04
PES1-202ENST00000354694 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.67■■■□□ 2.02
PES1-202ENST00000354694 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.6■■■□□ 2.01
PES1-202ENST00000354694 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.5■■□□□ 1.99
PES1-202ENST00000354694 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP27.49■■□□□ 1.99
PES1-202ENST00000354694 SMARCA2P51531 1590 aa27.48■■□□□ 1.99
PES1-202ENST00000354694 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.44■■□□□ 1.98
PES1-202ENST00000354694 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
PES1-202ENST00000354694 NCAPD3P42695 1498 aa27.18■■□□□ 1.94
PES1-202ENST00000354694 TRIM41Q8WV44 630 aa27.17■■□□□ 1.94
PES1-202ENST00000354694 HMGXB3Q12766 1538 aa27.15■■□□□ 1.94
PES1-202ENST00000354694 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.07■■□□□ 1.92
PES1-202ENST00000354694 ABCC8Q09428 1581 aa27.03■■□□□ 1.92
PES1-202ENST00000354694 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa26.85■■□□□ 1.89
PES1-202ENST00000354694 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
PES1-202ENST00000354694 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.71■■□□□ 1.87
PES1-202ENST00000354694 SYNJ1O43426 1573 aa26.66■■□□□ 1.86
PES1-202ENST00000354694 CFTRP13569 1480 aa26.66■■□□□ 1.86
PES1-202ENST00000354694 PRDM2Q13029 1718 aa26.6■■□□□ 1.85
PES1-202ENST00000354694 EHMT2Q96KQ7 1210 aa26.53■■□□□ 1.84
PES1-202ENST00000354694 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.52■■□□□ 1.84
PES1-202ENST00000354694 SOGA1O94964 1423 aa26.52■■□□□ 1.84
PES1-202ENST00000354694 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.48■■□□□ 1.83
PES1-202ENST00000354694 TOP2BQ02880 1626 aa26.47■■□□□ 1.83
PES1-202ENST00000354694 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.45■■□□□ 1.82
PES1-202ENST00000354694 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.44■■□□□ 1.82
PES1-202ENST00000354694 CUX1P39880 1505 aa26.39■■□□□ 1.82
PES1-202ENST00000354694 NESP48681 1621 aa26.38■■□□□ 1.81
PES1-202ENST00000354694 EEA1Q15075 1411 aa26.31■■□□□ 1.8
PES1-202ENST00000354694 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.27■■□□□ 1.8
PES1-202ENST00000354694 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26.27■■□□□ 1.8
PES1-202ENST00000354694 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.25■■□□□ 1.79
PES1-202ENST00000354694 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.07■■□□□ 1.76
PES1-202ENST00000354694 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.07■■□□□ 1.76
PES1-202ENST00000354694 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.06■■□□□ 1.76
PES1-202ENST00000354694 KIF21BO75037 1637 aa26.05■■□□□ 1.76
PES1-202ENST00000354694 GOLGA3Q08378 1498 aa26.04■■□□□ 1.76
PES1-202ENST00000354694 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.04■■□□□ 1.76
PES1-202ENST00000354694 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.02■■□□□ 1.76
PES1-202ENST00000354694 UBTFP17480 764 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
PES1-202ENST00000354694 TOPBP1Q92547 1522 aa26.01■■□□□ 1.76
PES1-202ENST00000354694 KIF27Q86VH2 1401 aa25.98■■□□□ 1.75
PES1-202ENST00000354694 TNIKQ9UKE5 1360 aa25.98■■□□□ 1.75
PES1-202ENST00000354694 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
PES1-202ENST00000354694 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa25.95■■□□□ 1.75
PES1-202ENST00000354694 CUX2O14529 1486 aa25.93■■□□□ 1.74
PES1-202ENST00000354694 CEP162Q5TB80 1403 aa25.93■■□□□ 1.74
PES1-202ENST00000354694 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
PES1-202ENST00000354694 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.88■■□□□ 1.73
PES1-202ENST00000354694 PRXQ9BXM0 1461 aa25.87■■□□□ 1.73
PES1-202ENST00000354694 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.81■■□□□ 1.72
PES1-202ENST00000354694 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.79■■□□□ 1.72
PES1-202ENST00000354694 PCGF6Q9BYE7 350 aa25.78■■□□□ 1.72
PES1-202ENST00000354694 IGF1RP08069 1367 aa25.77■■□□□ 1.72
PES1-202ENST00000354694 WDR97A6NE52 1622 aa25.75■■□□□ 1.71
PES1-202ENST00000354694 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.7■■□□□ 1.7
PES1-202ENST00000354694 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
PES1-202ENST00000354694 CLIP1P30622 1438 aa25.67■■□□□ 1.7
PES1-202ENST00000354694 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa25.65■■□□□ 1.7
PES1-202ENST00000354694 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.7
PES1-202ENST00000354694 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
PES1-202ENST00000354694 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
PES1-202ENST00000354694 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
PES1-202ENST00000354694 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.6■■□□□ 1.69
PES1-202ENST00000354694 ERCC6Q03468 1493 aa25.6■■□□□ 1.69
PES1-202ENST00000354694 WDR62O43379 1518 aa25.56■■□□□ 1.68
PES1-202ENST00000354694 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.54■■□□□ 1.68
PES1-202ENST00000354694 CUL7Q14999 1698 aa25.53■■□□□ 1.68
PES1-202ENST00000354694 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
PES1-202ENST00000354694 VPS8Q8N3P4 1428 aa25.45■■□□□ 1.66
PES1-202ENST00000354694 PBRM1Q86U86 1689 aa25.44■■□□□ 1.66
PES1-202ENST00000354694 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.42■■□□□ 1.661e-8■■■■□ 20
PES1-202ENST00000354694 ARAP1Q96P48 1450 aa25.41■■□□□ 1.66
PES1-202ENST00000354694 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
PES1-202ENST00000354694 IFT140Q96RY7 1462 aa25.39■■□□□ 1.66
PES1-202ENST00000354694 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
PES1-202ENST00000354694 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa25.38■■□□□ 1.65
PES1-202ENST00000354694 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa25.36■■□□□ 1.65
PES1-202ENST00000354694 HRCP23327 699 aa25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.7 ms