RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000354694.11

PES1-202, Transcript of pescadillo ribosomal biogenesis factor 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PES1, Length 2,295 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PES1-202ENST00000354694 NISCHQ9Y2I1 1504 aa36.48■■■■□ 3.43
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PES1-202ENST00000354694 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.25■■■□□ 2.43
PES1-202ENST00000354694 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.09■■■□□ 2.41
PES1-202ENST00000354694 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa30.04■■■□□ 2.4
PES1-202ENST00000354694 ABCC9O60706 1549 aa29.94■■■□□ 2.38
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PES1-202ENST00000354694 NACADO15069 1562 aa29.44■■■□□ 2.3
PES1-202ENST00000354694 SCRIBQ14160 1630 aa29.31■■■□□ 2.28
PES1-202ENST00000354694 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.17■■■□□ 2.26
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PES1-202ENST00000354694 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.43■■■□□ 2.14
PES1-202ENST00000354694 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.4■■■□□ 2.14
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PES1-202ENST00000354694 WIZO95785 1651 aa28.09■■■□□ 2.09
PES1-202ENST00000354694 SMARCA4P51532 1647 aa28.03■■■□□ 2.08
PES1-202ENST00000354694 CHIC1Q5VXU3 224 aa27.79■■■□□ 2.04
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PES1-202ENST00000354694 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.5■■□□□ 1.99
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PES1-202ENST00000354694 SMARCA2P51531 1590 aa27.48■■□□□ 1.99
PES1-202ENST00000354694 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.44■■□□□ 1.98
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PES1-202ENST00000354694 HMGXB3Q12766 1538 aa27.15■■□□□ 1.94
PES1-202ENST00000354694 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.07■■□□□ 1.92
PES1-202ENST00000354694 ABCC8Q09428 1581 aa27.03■■□□□ 1.92
PES1-202ENST00000354694 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa26.85■■□□□ 1.89
PES1-202ENST00000354694 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
PES1-202ENST00000354694 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.71■■□□□ 1.87
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PES1-202ENST00000354694 PRDM2Q13029 1718 aa26.6■■□□□ 1.85
PES1-202ENST00000354694 EHMT2Q96KQ7 1210 aa26.53■■□□□ 1.84
PES1-202ENST00000354694 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.52■■□□□ 1.84
PES1-202ENST00000354694 SOGA1O94964 1423 aa26.52■■□□□ 1.84
PES1-202ENST00000354694 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.48■■□□□ 1.83
PES1-202ENST00000354694 TOP2BQ02880 1626 aa26.47■■□□□ 1.83
PES1-202ENST00000354694 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.45■■□□□ 1.82
PES1-202ENST00000354694 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.44■■□□□ 1.82
PES1-202ENST00000354694 CUX1P39880 1505 aa26.39■■□□□ 1.82
PES1-202ENST00000354694 NESP48681 1621 aa26.38■■□□□ 1.81
PES1-202ENST00000354694 EEA1Q15075 1411 aa26.31■■□□□ 1.8
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PES1-202ENST00000354694 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26.27■■□□□ 1.8
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PES1-202ENST00000354694 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.07■■□□□ 1.76
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PES1-202ENST00000354694 KIF27Q86VH2 1401 aa25.98■■□□□ 1.75
PES1-202ENST00000354694 TNIKQ9UKE5 1360 aa25.98■■□□□ 1.75
PES1-202ENST00000354694 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
PES1-202ENST00000354694 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa25.95■■□□□ 1.75
PES1-202ENST00000354694 CUX2O14529 1486 aa25.93■■□□□ 1.74
PES1-202ENST00000354694 CEP162Q5TB80 1403 aa25.93■■□□□ 1.74
PES1-202ENST00000354694 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
PES1-202ENST00000354694 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.88■■□□□ 1.73
PES1-202ENST00000354694 PRXQ9BXM0 1461 aa25.87■■□□□ 1.73
PES1-202ENST00000354694 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.81■■□□□ 1.72
PES1-202ENST00000354694 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.79■■□□□ 1.72
PES1-202ENST00000354694 PCGF6Q9BYE7 350 aa25.78■■□□□ 1.72
PES1-202ENST00000354694 IGF1RP08069 1367 aa25.77■■□□□ 1.72
PES1-202ENST00000354694 WDR97A6NE52 1622 aa25.75■■□□□ 1.71
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PES1-202ENST00000354694 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.6■■□□□ 1.69
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PES1-202ENST00000354694 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
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PES1-202ENST00000354694 PBRM1Q86U86 1689 aa25.44■■□□□ 1.66
PES1-202ENST00000354694 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.42■■□□□ 1.661e-8■■■■□ 20
PES1-202ENST00000354694 ARAP1Q96P48 1450 aa25.41■■□□□ 1.66
PES1-202ENST00000354694 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
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PES1-202ENST00000354694 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
PES1-202ENST00000354694 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa25.38■■□□□ 1.65
PES1-202ENST00000354694 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa25.36■■□□□ 1.65
PES1-202ENST00000354694 HRCP23327 699 aa25.3■■□□□ 1.64
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