Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CHAF1AQ13111 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CHAF1AQ13111 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CHAF1AQ13111 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CHAF1AQ13111 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CHAF1AQ13111 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
CHAF1AQ13111 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CHAF1AQ13111 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
CHAF1AQ13111 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CHAF1AQ13111 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CHAF1AQ13111 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CHAF1AQ13111 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CHAF1AQ13111 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CHAF1AQ13111 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CHAF1AQ13111 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CHAF1AQ13111 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CHAF1AQ13111 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CHAF1AQ13111 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CHAF1AQ13111 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CHAF1AQ13111 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CHAF1AQ13111 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CHAF1AQ13111 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CHAF1AQ13111 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CHAF1AQ13111 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CHAF1AQ13111 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CHAF1AQ13111 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CHAF1AQ13111 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CHAF1AQ13111 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CHAF1AQ13111 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CHAF1AQ13111 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CHAF1AQ13111 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CHAF1AQ13111 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CHAF1AQ13111 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CHAF1AQ13111 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CHAF1AQ13111 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CHAF1AQ13111 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CHAF1AQ13111 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
CHAF1AQ13111 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CHAF1AQ13111 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CHAF1AQ13111 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CHAF1AQ13111 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CHAF1AQ13111 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
CHAF1AQ13111 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
CHAF1AQ13111 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
CHAF1AQ13111 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
CHAF1AQ13111 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
CHAF1AQ13111 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
CHAF1AQ13111 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
CHAF1AQ13111 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CHAF1AQ13111 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CHAF1AQ13111 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
CHAF1AQ13111 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
CHAF1AQ13111 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CHAF1AQ13111 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CHAF1AQ13111 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CHAF1AQ13111 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CHAF1AQ13111 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CHAF1AQ13111 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CHAF1AQ13111 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CHAF1AQ13111 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CHAF1AQ13111 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CHAF1AQ13111 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CHAF1AQ13111 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CHAF1AQ13111 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CHAF1AQ13111 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CHAF1AQ13111 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CHAF1AQ13111 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CHAF1AQ13111 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CHAF1AQ13111 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
CHAF1AQ13111 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CHAF1AQ13111 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CHAF1AQ13111 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CHAF1AQ13111 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CHAF1AQ13111 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
CHAF1AQ13111 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CHAF1AQ13111 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
CHAF1AQ13111 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CHAF1AQ13111 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
CHAF1AQ13111 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
CHAF1AQ13111 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CHAF1AQ13111 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CHAF1AQ13111 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CHAF1AQ13111 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CHAF1AQ13111 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CHAF1AQ13111 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CHAF1AQ13111 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CHAF1AQ13111 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CHAF1AQ13111 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CHAF1AQ13111 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CHAF1AQ13111 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CHAF1AQ13111 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CHAF1AQ13111 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CHAF1AQ13111 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.84
CHAF1AQ13111 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
CHAF1AQ13111 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CHAF1AQ13111 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
CHAF1AQ13111 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
CHAF1AQ13111 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
CHAF1AQ13111 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CHAF1AQ13111 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
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