Protein–RNA interactions for Protein: P82251

SLC7A9, b(0,+)-type amino acid transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A9P82251 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLC7A9P82251 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLC7A9P82251 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLC7A9P82251 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLC7A9P82251 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC7A9P82251 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC7A9P82251 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC7A9P82251 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC7A9P82251 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLC7A9P82251 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC7A9P82251 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC7A9P82251 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC7A9P82251 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC7A9P82251 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC7A9P82251 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC7A9P82251 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC7A9P82251 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC7A9P82251 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
SLC7A9P82251 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC7A9P82251 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC7A9P82251 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC7A9P82251 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC7A9P82251 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC7A9P82251 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC7A9P82251 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC7A9P82251 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC7A9P82251 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC7A9P82251 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC7A9P82251 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC7A9P82251 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SLC7A9P82251 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLC7A9P82251 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC7A9P82251 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC7A9P82251 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC7A9P82251 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC7A9P82251 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC7A9P82251 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC7A9P82251 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC7A9P82251 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC7A9P82251 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC7A9P82251 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC7A9P82251 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC7A9P82251 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC7A9P82251 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC7A9P82251 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC7A9P82251 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC7A9P82251 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC7A9P82251 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC7A9P82251 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC7A9P82251 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC7A9P82251 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC7A9P82251 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC7A9P82251 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC7A9P82251 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC7A9P82251 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC7A9P82251 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC7A9P82251 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC7A9P82251 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC7A9P82251 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC7A9P82251 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC7A9P82251 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SLC7A9P82251 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SLC7A9P82251 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC7A9P82251 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC7A9P82251 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC7A9P82251 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC7A9P82251 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC7A9P82251 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC7A9P82251 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC7A9P82251 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC7A9P82251 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC7A9P82251 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC7A9P82251 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC7A9P82251 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC7A9P82251 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC7A9P82251 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC7A9P82251 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC7A9P82251 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC7A9P82251 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC7A9P82251 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC7A9P82251 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC7A9P82251 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC7A9P82251 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC7A9P82251 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC7A9P82251 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC7A9P82251 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC7A9P82251 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC7A9P82251 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC7A9P82251 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SLC7A9P82251 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC7A9P82251 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC7A9P82251 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC7A9P82251 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC7A9P82251 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC7A9P82251 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC7A9P82251 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC7A9P82251 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC7A9P82251 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC7A9P82251 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC7A9P82251 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms