Protein–RNA interactions for Protein: P68104

EEF1A1, Elongation factor 1-alpha 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1A1P68104 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EEF1A1P68104 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EEF1A1P68104 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EEF1A1P68104 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EEF1A1P68104 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EEF1A1P68104 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EEF1A1P68104 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EEF1A1P68104 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EEF1A1P68104 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EEF1A1P68104 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EEF1A1P68104 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EEF1A1P68104 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EEF1A1P68104 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EEF1A1P68104 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EEF1A1P68104 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EEF1A1P68104 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EEF1A1P68104 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EEF1A1P68104 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EEF1A1P68104 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EEF1A1P68104 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EEF1A1P68104 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EEF1A1P68104 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EEF1A1P68104 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EEF1A1P68104 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EEF1A1P68104 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
EEF1A1P68104 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
EEF1A1P68104 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EEF1A1P68104 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
EEF1A1P68104 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EEF1A1P68104 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EEF1A1P68104 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EEF1A1P68104 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EEF1A1P68104 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EEF1A1P68104 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
EEF1A1P68104 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EEF1A1P68104 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EEF1A1P68104 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EEF1A1P68104 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EEF1A1P68104 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EEF1A1P68104 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EEF1A1P68104 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EEF1A1P68104 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EEF1A1P68104 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EEF1A1P68104 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EEF1A1P68104 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EEF1A1P68104 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EEF1A1P68104 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EEF1A1P68104 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EEF1A1P68104 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EEF1A1P68104 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EEF1A1P68104 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EEF1A1P68104 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EEF1A1P68104 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
EEF1A1P68104 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
EEF1A1P68104 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EEF1A1P68104 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EEF1A1P68104 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EEF1A1P68104 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EEF1A1P68104 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EEF1A1P68104 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
EEF1A1P68104 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EEF1A1P68104 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EEF1A1P68104 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EEF1A1P68104 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EEF1A1P68104 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EEF1A1P68104 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EEF1A1P68104 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EEF1A1P68104 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EEF1A1P68104 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EEF1A1P68104 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
EEF1A1P68104 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EEF1A1P68104 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EEF1A1P68104 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EEF1A1P68104 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EEF1A1P68104 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EEF1A1P68104 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EEF1A1P68104 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EEF1A1P68104 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EEF1A1P68104 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EEF1A1P68104 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EEF1A1P68104 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EEF1A1P68104 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
EEF1A1P68104 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EEF1A1P68104 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EEF1A1P68104 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EEF1A1P68104 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EEF1A1P68104 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EEF1A1P68104 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EEF1A1P68104 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EEF1A1P68104 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EEF1A1P68104 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EEF1A1P68104 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EEF1A1P68104 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EEF1A1P68104 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EEF1A1P68104 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EEF1A1P68104 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EEF1A1P68104 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EEF1A1P68104 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EEF1A1P68104 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EEF1A1P68104 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms