Protein–RNA interactions for Protein: P60484

PTEN, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase and dual-specificity protein phosphatase PTEN, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTENP60484 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PTENP60484 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PTENP60484 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PTENP60484 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PTENP60484 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PTENP60484 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PTENP60484 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PTENP60484 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
PTENP60484 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTENP60484 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PTENP60484 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
PTENP60484 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTENP60484 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTENP60484 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PTENP60484 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTENP60484 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTENP60484 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTENP60484 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTENP60484 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTENP60484 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PTENP60484 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PTENP60484 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTENP60484 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
PTENP60484 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTENP60484 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTENP60484 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
PTENP60484 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTENP60484 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PTENP60484 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PTENP60484 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTENP60484 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTENP60484 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTENP60484 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
PTENP60484 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PTENP60484 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PTENP60484 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PTENP60484 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
PTENP60484 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PTENP60484 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PTENP60484 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PTENP60484 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
PTENP60484 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTENP60484 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PTENP60484 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PTENP60484 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTENP60484 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTENP60484 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTENP60484 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTENP60484 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTENP60484 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PTENP60484 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTENP60484 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
PTENP60484 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTENP60484 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTENP60484 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
PTENP60484 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PTENP60484 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTENP60484 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
PTENP60484 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
PTENP60484 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTENP60484 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTENP60484 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTENP60484 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTENP60484 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTENP60484 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PTENP60484 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PTENP60484 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PTENP60484 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTENP60484 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTENP60484 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTENP60484 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTENP60484 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTENP60484 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PTENP60484 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PTENP60484 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PTENP60484 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PTENP60484 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PTENP60484 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PTENP60484 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
PTENP60484 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTENP60484 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTENP60484 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTENP60484 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTENP60484 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTENP60484 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTENP60484 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTENP60484 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTENP60484 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTENP60484 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTENP60484 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PTENP60484 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PTENP60484 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTENP60484 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTENP60484 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PTENP60484 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTENP60484 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTENP60484 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTENP60484 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTENP60484 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTENP60484 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.6 ms